斯露学园的箱子人的数量逐渐增加，艾利密欧带着学生会成员夺走一辆巴士，成功地从学园殖民星逃走出来；在避难区他们遇到了妮娜和受伤的爱尔·斯露。这个时候，支配着kirkwood的Nerval把人类箱子化计划告知几位原来的阁僚们，而阿蕾达也着奈美来到Nerval那里。奈美对Nerval以人类模样活动和被其洗脑的姐姐·高岭的感到惊讶。Nerval向奈美说要“一起守护这个世界”。另一方面，受到库桑齐贝的空间跳跃的影响，秋叶等人来到木星轨道；从这里回到kirkwood可要花费5年的时间。追究起责任，伊月和秋叶吵起架来。这时，小樱注意到木星轨道漂浮着雷欧帕尔德和弁庆的殖民星。雷欧帕尔德殖民星因为自动归航系统的起动而回到了木星——50年前大战结束后雷欧帕尔德和穗乃香的沉睡的地方。于是大家向殖民星蹦去。秋叶来到雷欧帕尔德的头脑室，伊月来到图书馆，穗乃香来到沙漠地带，为各自的事不约而同地流下眼泪。但是，在大家沉浸在感伤不久，被极光覆盖的殖民星的上空出现了放电现象。