空中城市的规模不断扩展，世界上许多城市的人们因为恐惧而暴动。一色真被撤职后，功刀司令回到总部。就在这时，MU族开始行动，世界发生重合现象。九鬼正义的拟像出现在总部，并向众人宣布了最后通牒。紧接着D-1来袭，破坏力非常惊人。然而，Rah还在卵化状态，无法作战。这时，功刀司令做出了决定。