基拉与地球联合军的军官玛琉一起乘上唯一未被夺走的强袭高达，离开了陷入爆炸之中的工场。但是，ZAFT军的MS正守候在工场外面。负伤的玛琉无法操作强袭高达，危急时刻，基拉代替玛琉开始驾驶强袭高达，并修正了高达的操作系统。潜在能力被解放出来的强袭高达轻而易举地击破了ZAFT军的MS。然而，危机解除后，基拉和他的朋友们却被玛琉以涉及军事机密而“挟持”。同一时刻，前来接收高达的大天使号的残余人员在娜塔尔少尉的带领下，启动了大天使号；得知消息的穆也回到了赫利奥波利斯的内部对大天使号进行援护。大天使号与ZAFT军就在殖民地卫星的内部展开了激战。