小林少年在直到升入初中二年级的今天为止，都未曾感到过活着的喜悦。这和死亡没有什么区别。某天，他在变得七零八落的尸体前醒来。那竟然是被杀害的担任教师。小林少年首当其冲被警察怀疑，并被当做嫌疑犯遭到逮捕。由于证据不足而被释放的小林少年，前往拜访了明智侦探。他是年仅17岁就得到政府许可证的少年侦探。今时此地，围绕着神秘的“人间椅子”，小林少年和明智侦探的推理开始了。