因为方南学园疾走部的比赛影片而对此项运动非常着迷的少女樱井奈奈，高中后进入方南学园就读。同为新生的藤原尊也是疾走的爱好者，两人来到憧憬已久的疾走部，而此时的疾走部处于荒废状态，全部成员只有社长支仓希斯、小日向穗积和将棋部的门胁步。距离组队还差一人，藤原盯上了运动神经发达的同班新生八神陆，新生VS社团老生，用疾走一决胜负。

有了部员、经理和教练，方南学园疾走部终于复活了。坛老师带来了第一场比赛的消息，是月末的“吉祥寺春季疾走节”。但想要参加比赛，疾走部还得拉到赞助才行，目前这种状况只有去拜托D’s集团了，因为希斯的姐姐正是D’s的社长。姐姐简单就答应了赞助，但她不仅要疾走部获得首场胜利，还要他们担任新品服装的模特。

西星学园疾走部的成员不光玩疾走，还做起了偶像，其组合名为“银河旗帜”。银河旗帜的表演过后，西星与方南的比赛就要开始了。陆与黛游马、小日向与千代松万太郎、希斯与妹尾匡、门胁与奥村枫、尊与诹访怜治，五人分组展开疾走对决，方南能打败如此强劲的对手吗？

下周日就是夏季终结者的预选赛了，方南学园的对手是以鲤鱼旗而出名的三桥高中。在之前与西星学园的比赛中，门胁不擅长跨越障碍的弱点彻底曝光，为此他特意找到擅长翻越障碍的小日向进行特训。比赛正式开始，面对人高马大的三桥选手，为了不成为大家的累赘，门胁做出了震惊全场的举动。

门胁的锁骨骨折，恐怕没办法参加接下来的比赛了，找到替补队员成了方南疾走部的唯一希望。一年级的三人四处走访，却没有一个人想加入疾走部，曾经的疾走部成员久我恭介拒绝了他们的邀请，而小日向也十分抵触久我的加入。一年前的疾走部发生了KGB事件，而事件的主角正是久我……

久我前辈华丽回归，方南疾走部回到巅峰时期。一条馆高中与方南的比赛开始，一条馆的指挥堂园志贵一场上就挑衅奈奈，双方火药味十足。第一棒的陆被对手刺激，内心动摇的他被对手反超。希斯拼尽全力追赶却误入对方圈套，他和久我很可能会相撞，重复去年的悲剧。再次携手的希斯与久我会如何应对？

淘汰赛的决赛在即，方南和西星在西星学园的疾走部集训所进行共同集训，这里的豪华设备亮瞎了方南疾走部全员，尊更是有了要转学到西星的念头。双方迎来第一场训练赛，一番较量后，方南体会到了与西星的差距。各种高强度训练之后，大家终于等来了豪华大餐和温泉兵乓球大赛。

EOS淘汰赛决战在即，终于迎来了决定东日本顶点的时刻，这次方南的对手是宫城花京院高校。在火车上，奈奈结识了花京院的指挥夏凪瞳弥。对手的教练是被称作疾走之父的“国王”樱井让，而他竟然是奈奈多年未年的爸爸。陆的哥哥八神巴也在花京院的队伍中，这注定是一场艰难的比赛。

计时赛中，方南被花京院拉开了很大差距，决赛在一个月后，尽管大家都在拼命练习，但状态并不好，尤其是陆和尊，两人还差点打起来。奈奈的爸爸邀请她加入花京院，这让奈奈陷入两难的境地。为了缓和紧张氛围，在步的提议下，方南疾走部全员来到泳池，进行“水乳交融计划”。

训练还在继续，陆的心结始终都是跑在前方的哥哥，这使他一直无法跟上队友的步伐，越是练习成绩反而越不好。疾走本来应该是开心的，如今陆却愈加不自信了，还总是躲着队友，团体练习也开始缺席。就在他闹脾气的时候，过去的场景再次浮现，这时尊的一句话点醒了他，我想和你一起跑啊。

明天就是方南和西星的半决赛了，尊的豪言壮语让陆和奈奈热血沸腾。命运的一天终于拉开帷幕，冷板凳队员门胁依旧没有上场机会。首发跑者是小日向与万太郎，因为这次是希斯和久我今年的最后一次比赛，为了避免失误小日向略显谨慎，因此被对手万太郎超过，但比赛还在继续……

EOS决赛迫在眉睫，就在此时，尊做出了让大家震惊的决定，让陆接跑最后一棒，和哥哥巴正面对抗。众人紧锣密鼓进行着练习，就这样，EOS决赛终于开始，就连银河旗帜也跑来给方南加油。方南对战花京院，陆与巴兄弟俩终于冰释前嫌，尊和陆能否完成多年前的夺冠约定？