遥远的异世界——为了拯救世界，被称作“灾厄歼灭者”的英雄夏古鲁亚出发前往讨伐绝代的死灵使“尸神殿”。一番激烈的战斗过后，在夏古鲁亚上前确认是否打倒了尸神殿时，魔法发动，四周被光芒笼罩。那一瞬间，他的灵魂从遥远的异世界转移到了现代的新宿，在名为“四乃山波尔卡”的少年体内苏醒过来。他拖着喉咙被割断，不久前刚刚遭到杀害的身体徘徊在新宿的街头，随后被某名少女救了下来。在和这名自称“崎宫美咲”的少女对峙的时候，波尔卡的记忆逐渐复苏。将四乃山波尔卡杀害的正是眼前这名少女“崎宫美咲”。为了再次了结波尔卡的性命，少女向他发动了袭击。

死灵使“尸神殿”为寻求平稳的生活而转生到现代的新宿。转生至波尔卡体内的他在试图击退袭击自己的少女“崎宫美笑”时失手杀掉了她，而这一幕恰巧被“情报贩子·缲屋匠”的无人机给拍了下来，在接到他的消息后“中介屋·克拉丽莎”找到了波尔卡。那时她们看到了波尔卡试图使用魔术“修复”本已丧命的美笑的身体。克拉丽莎的部下们因为这预料之外的景象而感到无比困惑，纷纷举枪对准了波尔卡。在冲突一触即发的紧张氛围当中，突然响起一阵警笛声。得知孩子们被卷入火灾当中，波尔卡为了救出他们朝发生火灾的大楼飞奔而去。

波尔卡在“拷问大楼”里住了下来，并和成为同伴的缲屋匠以及崎宫美笑一起开始摸索如何才能安稳度日。有个想要委托“杀手猎人”美笑工作的男人造访了大楼。男人说他希望委托美笑处理掉她在过去抹杀的杀手阵场的同伴们，然而，这却是阵场的同伴们设下的陷井。美笑遭受到事先埋伏在那里的男人们突如其来的袭击。虽然她轻松化解掉了袭击，但却被委托她这项工作的男人从背后开枪射穿了身体。另一方面，为了调查波尔卡所引发的异常事件，新宿警察局生活安全科第三数据编辑系——通称“三辑”的刑警们开始采取行动。

难以公开，即便公开也只会让人认为是天方夜谭的奇怪犯罪——新宿警察局生活安全科第三数据编辑系，通称“三辑”专门负责处理这种事件。以系长“岩野目椿”为首的三辑成员们将这类犯罪者称呼为“灾厄”，并持续对尚未解决的事件进行追查。在三辑的搜查物件名簿上新添一笔的，正是在火灾现场出现的白骨以及“打结”在一起的男人们——这起由波尔卡引发的事件。三辑的刑警“荒濑耿三郎”遇到了波尔卡和美笑，并看出美笑是“打结”事件的相关人员。另一方面，对克拉丽莎起疑的岩野目在酒吧“天桃孤狼”对她展开追问。与此同时，波尔卡和美笑来到了酒吧。

黑暗中，波尔卡一行人与旅鼠军团展开对峙。旅鼠军团试图带走美笑，但波尔卡因为怕被岩野目他们看到自身施展魔术，以及和旅鼠军团进行对决会使安稳的生活渐行渐远而犹豫不决，导致他未能及时出手。然而原本抱定主意抛弃美笑逃走的波尔卡却对试图逃离的旅鼠军团施展魔术，夺回了美笑。击退旅鼠军团的波尔卡意识到为了获得安稳的生活，力量是不可或缺的，他让5年前死掉的“细吕木”的灵魂依附在自动铅笔上，决心与他一道开展占卜的工作。“四乃山华月”和“四乃山紫月”这对双胞胎姐弟在匠和细吕木的帮助下，顺风顺水地找到了赚取了不少钱财的占卜屋。

波尔卡和美笑结伴造访了四乃山家，见到了以“四乃山尊”为首的亲属们。虽然波尔卡的父亲四乃山吕算看穿了波尔卡不是他儿子本人，并进行了一连串的追问，但他却在察觉到危险逐渐逼近华月与紫月时前去救出她们。两年前，在亲戚五郎的指示下杀害两人的姐姐“四乃山凉火”的“赴火之虫”，这次盯上了双胞胎姐弟的性命。当华月与紫月被火焰逼得走投无路时，美笑和波尔卡将他们救了出来。赴火之虫遭到警察逮捕，在他乘坐的警车车顶上，被人用火焰刻下了文字。那是“真正的”赴火之虫在现场留下的信息。感到恐惧的“假”赴火之虫的身体则逐渐被火焰吞噬。

波尔卡顺利地完成了岩野目的占卜。然而，当岩野目看到细吕木在纸上写下的内容时，他的态度瞬间发生转变。写在纸上的是只有某个人和岩野目知道的标志。岩野目对克拉丽莎进行逼问，询问其唯一一个知道在占卜时得到的纸片上的标志的人物——细吕木是否还活着。细吕木生前作为监察官与岩野目共事，他利用占卜为岩野目提供重要的情报。与此同时，雪天鸦同样注意到了这一标志，并开始采取行动。在预告进行犯罪的当天，新宿的上空中突然浮起数不清的飞行船。波尔卡在见到描绘在船体上的标志时大吃一惊。那是波尔卡曾经身处的异世界——本已覆灭的帝国的国徽。

居室被烧掉的“四乃山小夜”来到了波尔卡的住处。据她所言，今后她打算要住在作为波尔卡居所的拷问大楼里。派遣四乃山的家人和其护卫，试图从波尔卡他们这里捞取好处，这便是吕算的计划。加上小夜和她的管家“小幽”，波尔卡一行人的崭新生活就此拉开序幕。然而，小幽在得知波尔卡是假冒的之后，即便是衷心钦佩的吕算的命令，他也无法接受保护波尔卡这件事。为了揭露波尔卡的真实身份，小幽每天晚上都在窃听波尔卡他们的对话。另一方面，岩野目注意到波尔卡是事件的中心人物，他来到波尔卡的占卜屋，并拜托波尔卡为自己占卜。

波尔卡顺利地完成了岩野目的占卜。然而，当岩野目看到细吕木在纸上写下的内容时，他的态度瞬间发生转变。写在纸上的是只有某个人和岩野目知道的标志。岩野目对克拉丽莎进行逼问，询问其唯一一个知道在占卜时得到的纸片上的标志的人物——细吕木是否还活着。细吕木生前作为监察官与岩野目共事，他利用占卜为岩野目提供重要的情报。与此同时，雪天鸦同样注意到了这一标志，并开始采取行动。在预告进行犯罪的当天，新宿的上空中突然浮起数不清的飞行船。波尔卡在见到描绘在船体上的标志时大吃一惊。那是波尔卡曾经身处的异世界——本已覆灭的帝国的国徽。

雪天鸦描绘在飞行船上的标志，是曾给波尔卡留下珍贵回忆的帝国的国徽，并且和细吕木作为重要线索托付给岩野目的那个标志十分相似。在飞行船上遭到狙击的雪天鸦在网路上发布视频，控诉有奇怪的组织混入了警察内部。波尔卡陷入动摇，有关转生以及帝国的喃喃自语都被小夜听到了，他不得已只好全盘托出。波尔卡称他无法对侮辱帝国国徽的家伙坐视不理。为了获取情报，匠骇进了警察的系统，得知岩野目正在搜集跟细吕木有关的情报。雪天鸦觉察到匠的黑客行为，得知了位于新宿的占卜屋的存在。

经过变装的雪天鸦造访了占卜屋，波尔卡对他的疑问作出解答，飞行船上的标志被多加上了一道横线。雪天鸦在得知了解标志的真实形状的波尔卡和狙击自己的组织有着某种形式上的联系后，为了搜集线索，在深夜入侵拷问大楼的楼顶，随即遭受到袭击。袭击他的是察觉到入侵者的小幽。与此同时，醒过来的波尔卡看到了赴火之虫用火焰刻在墙壁上的信息。赴火之虫甚至直接打电话过来询问波尔卡“你也是塞巴拉隆多的产物吗？”另一方面，得知小幽正在和雪天鸦交战的四乃山尊为了镇压混乱的局面而开始采取行动。

施展力量试图找出赴火之虫的波尔卡感知到雪天鸦和小幽在屋顶上。小幽和雪天鸦持续交战，旅鼠军团在这时突然从空中降下，挡在两人中间。与此同时，披着背后写有“警惕火焰”雨衣的女高中生拿着手机站在拷问大楼的前面。原本身处的世界里重要的回忆受到了玷污。想到这里，波尔卡为了压制眼下的局面发动了魔法阵。察觉到异变的雪天鸦放出烟雾试图逃离现场。无数只手自烟雾中浮现——这是波尔卡的死灵术“无形手群”。在场的人们都目击到了这一幕，事态变得愈发混乱。

波尔卡所释放的死灵术“无形手群”出现在直播主的直播中，并迅速地传播开来。结果，许多看热闹的人都一窝蜂似地涌进了拷问大楼。与此同时，匠询问波尔卡赴火之虫所留下的“塞巴拉隆多的产物”这句话的涵义，于是波尔卡便开始讲述他转生前所在的世界的那位帝国的宫廷魔术师“亚里乌斯塞巴拉隆多”。如果自己所抛弃的前世，与自己目前所在的世界有某种关联的话……波尔卡纠结着该如何面对这个事实。

胡蝶前来拷问大楼采访占卜师尸神殿，而她带来的是居然是“夭桃狐狼”的调酒师里井。令人惊讶的是，他的背后还跟着被阿牙仓百矢杀害的同事，也就是调酒师西田的灵魂。同时，总部的刑警们突然闯进了波尔卡的占卜店。他们说他们收到了“这栋大楼里藏有强盗”的线报。而警察们所出示的嫌疑人的照片上，不知为何却出现了西田的身影。另一方面，对总部强硬的行动感到讶异的克拉丽莎和岩野目，回忆起在拷问大楼发生的“五年前的事件”。而该事件的当事人细吕木，则催促着波尔卡去调查大楼的地下。在这个奇妙的巧合之下，波尔卡在地下所看到的是……

被冰黑给运到拷问大楼的西田的尸体，在总部的警察发现之前就被波尔卡给藏了起来。在警察离开后，随之而来的是岩野目和荒濑。为了不碰上荒濑，匠逃回了自己的家，但他却遭到了阿牙仓百矢和冰黑的袭击。“你们是怎么把西田的尸体给藏起的？”即便冰黑如此询问，匠却一直不肯回答。于是冰黑便开始折磨匠，并威胁他说：“如果你想活下去的话，除了跟我们合作以外，你已经别无选择了。”此时，居室的窗户突然爆炸。为了救匠，美咲破窗而入。但是，美咲被百矢刀切断了身体，冰黑让匠沉睡并带他去了某个地方。