总算安全度过了废校危机的音乃木坂学院，谬斯的成员们过着一如往常的校园生活。此时，她们却接获了“LoveLive!”即将再度举行的消息，只是本次的比赛规则有所修改，必须先通过地区预选赛，才能进入正式比赛。尽管μ’s在地区预选赛时就会和上一届冠军的“A-RISE”硬碰硬，成员们一时之间感到气馁，却也很快地振作起来，但穗乃果却说“就算不参赛也没关系”……

为了参加“LoveLive!”，谬斯再度开始活动。就在这时候，主办单位发表了新规定，地区预赛必须演唱从未发表过的歌曲。于是，必须在短短不到一个月时间内完成新歌的9人，决定到山上集训！住的当然是真姬家的别墅。一行人照惯例分配工作，由琴梨设计服装、海未作词、真姬作曲，但是三人都因为地区预赛非胜不可的压力而陷入低潮……

成功通过地区预赛的谬斯，在知道敌手A-RISE也同样地区通过预赛后，更加的卖力。但在这时妮可却不知为何没有参加练习就直接回家。感到奇怪的穗乃果等人因此跟踪了妮可，结果却看到她在超市买东西。虽然努力的继续跟踪但却被妮可给跑掉了。就在这时有个与妮可长得很相似的少女刚好经过，那个少女自称是妮可的妹妹……

在2年级去校外教学旅行的期间，凛被团员们选为代理领队。但是她却不太有意愿，显得很困惑。大家在练习时为了小事而意见分歧，被逼着要做出裁决的凛，却无法顺利的领导队员。花阳和真姬努力的要鼓励凛，但凛坚称自己不适合当领队，还直说自己一点也不可爱。原因似乎是出在小学时发生的事情……

谬斯受邀担任秋叶原万圣节活动的表演嘉宾。要在“LoveLive!”获得冠军，地区的声援也是不可缺乏的。大家想在活动中让观众留下深刻印象，在最终预赛前拉近与A-RISE的距离。但是她们还在计画时，A-RISE就在开幕活动炒热气氛、抢尽风头。错失先机的谬斯为了让观众能留下深刻印象，因此想改变团队的形象。这时，海未说要改变形象就必须彻底一点。

校内身体检查的结果显示，穗乃果体重增加了。她因此遭到海未指责太过松懈，还被要求穿上久没穿的第一次LIVE的服装，结果……。看到事实的穗乃果只好开始减肥，本以为事不关己的花阳也陷入同样的困境，两个人于是手牵手互相勉励加油。但是，学生会的社团活动预算会议也迫在眉睫，必须边执行学生会的工作边减肥的穗乃果却……

要决定最终预赛时唱的歌曲时，谬斯团员们个个意见分歧。就在这时，希提议说要做一首情歌。团员们对于不熟悉的歌曲类型感到有点动摇，不过绘里却意外的支持。虽然试着去模拟适合情歌情境的场景，却总觉得差那么一点。面对决定不要勉强唱情歌的成员，绘里提议希望大家再多考虑看看，但最后还是不了了之。这样的绘里，让真姬感到有疑问……

最终预赛当天，穗乃果等二年级生学生会成员，打算在学校说明会上打完招呼后再前往现场，但是外面下了大雪导致交通运输停摆，也因此让她们无法前往会场。决定还是要试着前往会场的三个人，开始走在积满了雪的路上。这时先抵达会场的成员们，正为舞台的高规格吃惊。加上A-RISE的胜利宣言，让六个人感到非常不安……

迎接新年、出外新年参拜的穗乃果等人，偶然遇到了A-RISE，A-RISE也对她们说了一些鼓励的话。谬斯在东京地区的最终预赛顺利过关了。能参加大会的团队，必须在团队介绍网页中刊登宣传口号。穗乃果她们努力思考能完整形容谬斯的一句话，但却没有好点子。之后A-RISE的领队小翼突然出现在穗乃果面前……

雪穗和亚里沙平安的考上了音乃木坂学院，九个人开始讨论谬斯今后的事。妮可认为就算换了团员也应该要继续下去，但花阳却觉得有这九个人才算是谬斯。结果还是讨论不出结论来，绘里认为这应该是留下来的团员要决定的事。因此剩下的六个人决定要讨论出结果。各自想着关于谬斯的未来而彻夜难眠……

LoveLive！结束后谬斯将要解散。这是大家一起决定的事，在本大会前日团员们跟平常一样的集合在顶楼，在气氛很好的状况下结束了练习，就这样一想到这是九个人最后一次一起练习，在回家的路上每个人脚步都变得很沉重。结果穗乃果提出最后一夜要大家在学校里共渡一晚。虽然像集训时一样拥有愉快的气氛，但九人都在这新决意进入梦乡。隔天早上，大会当天终于来临了。

今天是学校的毕业典礼。终于将送别词完成的穗乃果很得意的前往了学校。与在校门前遇到的小凛们一同来到了社办，那里有着奖杯与旗子。谬斯获得了冠军。毕业典礼也准备好了，终于要正式开始了。穗乃果不太能适应这种场合，因此请真姬伴奏开始唱歌。之后全校学生也一起大合唱。然后毕业典礼也结束了，最后九个人一同绕了校园内……