“针对你这4年傲慢无礼的执政期，在此施下天诛的警告！”12月某天，朝仓东都知事收到一封恐吓信。第二天，刚开通的都营地铁隧道被炸毁。不过，多亏了从小五郎那里得知恐吓信的柯南，才避免了惨剧。柯南等人到建好水坝的新潟县去。迎接搬迁5周年纪念仪式的北之泽村，很多人在一起围观。柯南刚开始调查，却在雪原上发现了死因不明的遗体。“悲剧”相互交错，如今灾难正向人们袭来。