柯南与少年侦探团，来到西多摩市临近完工的日本第一高的双子塔大厦。这是最先进的高科技建筑，而在建设过程中，有可疑人物暗中活动。其后，在大楼内发生了第一起杀人案。在那附近，柯南目击到难以置信的东西。黑色的保时捷356A。并且灰原也开始与什么人秘密联系。