日暮戈薇在15岁生日当天被妖怪百足妖妇拖入自家神社的食古井内，穿越到了战国时期的村庄，巫女枫姥姥发觉戈薇和去世多年的姐姐——桔梗极其相像，认为她很有可能是桔梗的转世。百足妖妇再次来袭，并且打伤了戈薇，本该随着死去的桔梗一同火化的宝物四魂之玉，从戈薇体内出现。为了避免村庄受到伤害，戈薇单独把妖怪引到了被桔梗封印的半妖犬夜叉所在的森林，不得已之下解开了犬夜叉的封印，获得自由的犬夜叉杀死百足妖妇后也打起了四魂之玉的主意……