弘濑琢磨这名平凡的少年，与巨乳妹妹小萤、贫乳妹妹早美这两个没有血缘关系的妹妹住在一起。再加上儿时玩伴的滨路，让他过着充满酸甜苦辣却也令人羡慕的校园生活。某天，他在上学途中撞到一名一边大叫着“要迟到了！要迟到了！”，一边冲过来的神秘少女‧音羽。接着又出现一名企图将农业扩展至日本全国，让粮食自给率提升至100%并统治日本的邪恶魔法少女‧魔法农夫小唯！试图从小唯的魔掌中保护学园的是…来自精灵界的爱与希望之魔法少女‧魔法音羽！