因为被阿罗拉地区所吸引，小智和皮卡丘选择留宿在库库伊博士家，并且进入宝可梦学校学习。有一天，小智的同班同学为小智举办了一场秘密欢迎会。在热闹的欢迎会上，阿罗拉地区的守护神卡璞・鸣鸣来访了...？