火箭队依然追逐着小智的皮卡丘。有一天在宝可梦学校窥探宝可梦课程的火箭队，对小智使用的Z招式感到惊叹。为了能够尽快学习Z招式，火箭队前往寻找C纯晶。这时，同样看上纯晶的骷髅队出现了･･･火箭队和骷髅队，恶恶相碰!!