一天晚上，小智有个不可思议的梦。第二天早上上学时，小智遇到了一个从未实际见过的宝可梦！这是小智在梦中照顾过并立下约定的宝可梦。捡到的这个宝可梦是在洛托姆图鉴中完全没有记载的谜之宝可梦。小智并不知道该如何照顾这只宝可梦，因此和宝可梦学校的同学们陷入了苦恼中。