与同班同学美波、转学生阿尔玛，以及其他对策课成员一起度过校园生活的青春校园剧——这里是依照晓的意识所打造的虚拟空间。对策课成员们为了刺激晓恢复记忆潜入这个虚拟空间，却在此遇上一个悄悄介入的人物“尤古”。晓在此与面对这个出现在他记忆中，过去曾造成东京毁灭、装备着EX-ARM No.11、而且长得和自己如出一辙的Beta。他强烈地感受到，这个Beta正是所有灾难的源头。