鹦鹉螺号终于达到南极洲地下的广阔空洞的秘密基地。修理作业期间，尼莫带着让和娜蒂娅前往某个地方。在那途中，有一个将遥远的太古时期濒临灭绝的各种各样的生物冰封起来的冰之博物馆。看到未知的生命，让和娜蒂娅对大自然的不可思议惊讶万分。然后来到目的地，那里有一条被尼莫视为至友，活了两万年之久的白色鲸鱼伊利雍。