小智和小豪从樱木博士那里得知了“据说有座快龙们栖息的岛屿”的传闻，为了寻找那座岛屿他们踏上了旅途。搭乘途中小豪收服的白海狮出海的两人卷入了突如其来的暴风雨，被海浪冲走了。当两人在某座岛的海岸醒来时，出现在他们面前的是数量繁多的快龙们！