在樱木研究所举办的“宝可梦定向越野赛”中，小智和小豪担任领队。与参赛的孩子们一起愉快地进行宝可梦对战与收服的两个人，重新确立各自未竟的“梦想”。在那里，洛奇亚又出现了！？