小智为了赢得接下来宝可梦世界锦标赛的高级级和大师级比赛，而与小豪再次来到卡洛斯地区访问可尔妮，让路卡利欧成为超级进化。可尔妮赠与小智钥石，并帮助小智前往超级岛屿挑战超级进化仙人获得路卡利欧进化石。小豪收服喷火驼，小智和小豪得知超级进化仙人的真面目就是可可布尔。小智收到宝可梦世界锦标赛高级级的通知，并得知对手为位于第30名的彩豆。