柯南和元太等人在外玩耍时，遇到了三个对蜘蛛很有研究的人，于是大家兴致勃勃的观看浦崎所饲养的毒蜘蛛，这时，系川打电话给新野教授，可对面却传来一声惨叫。待大家到达研究所时，教授已经身亡，虽然柯南在现场发现了毒蜘蛛，却并没有找到相应的血清，并且他还发现有人对电话动了手脚，由此判断教授并非死于意外，这是一起谋杀案件，与教授相识的这三名蜘蛛爱好者都有杀人的动机，凶手一定就在他们之中。