阿笠博士带着少年侦探团去朋友家的别墅玩，众人却在别墅的院子里发现一名倒在血泊中的男子，经证实此人正是俗称“佐罗”的连环抢劫纵火犯的同党伊势原祐二。为了解开谜团，柯南只身一人前往深山，目睹了佐罗意图杀害伊势的场面。想要解围的柯南在和伊势一起逃亡的过程中被逼上了临海的悬崖，在佐罗的追杀中不慎坠落悬崖的二人命运将会如何？