神乐与出云的战斗打上了终止符——在阿马塔他们面前未影操纵的「黑色Aquarion」也显现出其姿态。被未影关入心之迷宫的神乐，在那里遇到了被囚禁的婕希卡。婕希卡为了阻止未影的暴走，恳切地求神乐将她自己杀死。另一方面，在未影乘坐的「黑色Aquarion」压倒性的力量的面前，仅有Aquarion Evol一台机完全没有办法可言。在最大的危机面前，阿马塔、安迪、怪炎、柚叶等Element们集中起来。将拥有的力量全部发挥出来——从2万4千年前延续下来的神话终于要迎来终结。