为了解明Aquarion的谜团而旅行的不动总司令和克蕾雅理事长回归。由克蕾雅透露出Aquarion的秘密。Aquarion是由朋友以上恋人未满这样近乎极限的感情发挥出力量——因柏林墙被破坏而还未来得及喜悦的学生们被告知“禁止恋爱”。男女混合队伍开始了不允许发展“恋爱”，在“恋爱”面前悬崖勒马的特训。