忍者教室的修行一日比一日来得严格，但云雀仍躲不过雾夜所射出的手里剑，于是柳生又忍不住保护了云雀。结果落得两人都被留下来加强修行。雾夜认为这五个学生，各自有着不同的特质，只要好好锻鍊的话都能有一番成就。回想三年前刚进入忍者科一年级的斑鸠和葛城，虽然起初互相厌恶对方，但现在却是比任何人都来的要好的拍档。两年前入学的飞鸟，虽然一开始也笨手笨脚的，但为了不负传说中忍者之孙的名号，也每日努力地修行着。另一方面，大道寺察觉到蛇女子学园的恶忍们，所使出的忍术都是当初一次也没赢过，同是忍者科的凛在忍者修行时所使用过的忍术。要做出了断的时刻也慢慢接近了。