基本粒子物理研究所CERM 的所长媞姆宣布，CERM将开发物质传送装置，也就是任意门。不久后，鉴的高中同学刀祢大和邀请他加入新日本综合研究团队KEC，而KEC的目的是抢先CERM完成任意门的研发。高中时期，制作任意门一直是鉴的梦想，而如今他却产生了动摇……