草薙接受久世的革命理论，并且命令攻壳车在计算机内存中确保可用空间，以便传送难民300万人份的记忆和灵魂。可是攻壳车却没有完全于草薙的命令，开始进行阻止核弹落下的作战计划，只是没想到用来制造弹幕的那颗主要卫星，却是搭载着攻壳车它们的AI。终于，核弹发射了！草薙与巴特他们听到远方传来攻壳车的歌声；随着强烈的闪光，蕈状云在出岛上空逐渐膨胀……大部分难民、陆特、围攻出岛的自卫队，还有9课在出岛的成员因为攻壳车的牺牲得以保全。茅葺派出航空自卫队秘密部队向美帝核潜艇展示了立场，进而逮捕了官房长官，在准备逮捕或击毙合田的时候发现CIA参与合田的计划，久世死在了CIA的暗杀下。