爱丽丝升入了高中二年级，在日本迎来了第二个春天。A班的新班主任久世桥老师也加入其中，忍、爱丽丝、绫、阳子、可怜组成的好朋友五人组度过着闪闪发亮的“金色的每一天”。但爱丽丝由于和忍分到不同班级而受到打击。“我想知道更多小忍的事！”对于忍的事情一知半解的爱丽丝想要尽可能多地去理解谜一般的忍，于是她开始进行把大家都卷进来的“忍的极秘调查”。