从和爱因斯沃斯的激战中暂时休息。救出了美游的伊莉雅等人，从平行世界的卫宫士郎那里得知了美游过去发生在这个世界上的圣杯战争。这是美游悲惨的命运，讲述了哥哥士郎为了美游拼上性命后踏上的壮烈战斗的故事。为了拯救人类牺牲了美游的爱因斯沃斯。士郎为了美游决定成为世界的敌人。面对无法相容的两个正义，伊莉雅发誓要守护一切。“我会帮你的。因为我已经决定找一条能帮助大家的路了！”。为了创造能和重要的人们一起欢笑的明天——。魔法少女们的战斗，再次开始……！