在损失了包括2艘航空母舰在内的6艘战舰之后，地球联合军舰队的残余部队被迫撤退，密涅瓦号成功突围。归舰的真因其不可思议的战绩而得到了威诺等人的欢呼，而同为MS机师的雷也对真的出色表现加以肯定；塔丽亚和阿瑟也逐渐明白了杜朗达尔议长将脉动高达交由真驾驶的用意。另一方面，尤拉加紧了对卡嘉莉的控制。他表示将在与大西洋联邦签署协议的同时举办婚礼；卡嘉莉虽然并不甘心，但在尤拉以方方面面的“大义”劝说之下，并无他法可想。由于政局的变动，寄居在玛尔基奥导师家里的安迪和玛琉敏锐地感觉到暴风雨即将到来，奥布不再是个能够容身的地方。果然，就在一天夜里，一支神秘的队伍突袭了玛尔基奥导师的家。由于哈罗的预警，基拉等人得以事先察觉，逃到了避难所里。在双方的交火中，安迪和玛琉发现这支神秘的队伍竟然是ZAFT的部队，而他们的目标则是拉克丝。看到普通武器无法对避难所造成威胁之后，神秘部队的指挥官下令使用MS对避难所进行攻击。面对千钧一发的危急状况，吉良驾驶自由高达出击，并发动了种能力轻易破坏了敌方所有MS的战斗力；神秘部队的指挥官只能选择自爆来销毁自军的痕迹。