小智和艾岚继续与弗拉达利对战，但被帕琦拉打断。帕琦拉决定将未来的希望寄托给小智和艾岚，并与他们联手对抗弗拉达利。小智得知帕琦拉也是闪焰队成员。大吾得知自己被欺骗，与弗拉达利决裂。他击败弗拉达利实验室驻守的闪焰队成员，并协助玛农、莎莉娜与布拉塔诺博士救出哈力君。希特隆击败库瑟洛斯奇，并用道馆的机关将他赶出去。希特洛伊特成功骇入心智系统，但由于需要强制关机才能停止巨大的神秘植物，以至于它牺牲自己。柚丽嘉利用歌声将小软从心智系统中解救出来在心智系统解除后，Z2恢复正常。