俄罗斯总统对学园都市发出了最后通牒，若在期限内没有做出应有的答覆，他们将会动用洲际飞弹对学园都市及其盟军展开侵略作战，然而态度强硬的学园都市也丝毫没有让步的打算，第三次世界大战眼看一触即发。另一方面，为了拯救自己最重要的事物，上条、滨面及一方通行来到了俄罗斯。而上条跟蕾莎在循着线索找寻右方之火下落的过程中，来到了伊利沙里纳独立国同盟。