在剑之介和由希奈的神经系中，植入了由纳米装置所构筑的与剑之介的“黑骸”战机相连的分子电路。现代科学技术是很难移出的，唯一能操作黑色残骸只有剑之介和由希奈，进入了联合国的指挥下从事。也算得上是从属于联合国的军属了，而且从属于同一部队还有同班同学索菲·诺艾尔，被禁止去学校的日子到此为止。平稳的日子终于回来了，想到这里的由希奈，等到的是久违的学校转校生，剑之介的身影。