为了保护萤娜而决定弑神的阿九斗，和彼得豪森一同飞向天际，但内阁魔术情报调查室的成员2V，却操纵政府军的巨大航空母舰“玄鹤”击坠阿九斗。另一方面，照屋荣子率领的政府军进入校内要讨伐占据学院的魔兽，却被学生会长白石莉莉挡住去路。荣子派服部优子保护自己，并且下令打倒莉莉…！阿九斗的死令不二子失魂落魄，但萤娜相信阿九斗还活着，望一郎则是在此时再度现身掳走萤娜。