安藤夏希新升入了高中，在选择社团时遇到了一只奇怪的海豹。随后夏希在初中同学古桥的推荐下来到了归宅部的部室，在这里见到了归宅部的部长道明寺樱等三人。在三人的怂恿下夏希和古桥加入了归宅部，原来那只奇怪的海豹就是归宅部的吉祥物。就这样在部长的安排下，作为新部员的两人参与进了社团的活动---喂鸽子，新部员和归宅部三人逐渐熟悉起来。

归宅部的众人在部室讨论俳句和战国武将的问题，一群人越扯越远，谈到了杜鹃如果不叫应该怎么办的问题。随后大家开始给杜鹃做俳句。花梨给众人带来了自己制作的曲奇，但是大家都不相信花梨会做料理，原来花梨初中时是家政部的部员，擅长各种手工和料理。次日归宅部的众人就联谊发表了各自的看法，大家为了练习联谊能力而展开了训练。

归宅部这天在讨论女子防身术的问题，于是樱扮成了流氓和牡丹开始训练大家防身术的要点，花梨很羡慕牡丹武功高强。牡丹为了锻炼自己的精神给大家看了自己十四岁时的日记。樱发现克雷雅十分宠爱花梨，众人开始讨论关于过分宠爱的坏处。星期天牡丹因为发现初中同学聚会没有叫自己去而十分生气，归宅部的众人安慰了她并了解了樱和牡丹过去的交往经历。

归宅部的众人参加了棒球比赛，部长樱作为投手上了场而牡丹作为接球手，两人通过奇怪的手势互相交流，结果完全没有效果，反而被对手破译了手势。次日众人讨论了防火避难的问题，樱对众人做了火警测试，随后牡丹和花梨讨论起了自己的锻炼和秋月流的历史，众人又讨论起了保持动画人气的重要性。

道明寺樱在部室大展歌喉，归宅部的其他人也开始了关于外国歌曲的讨论。部员们又聊到了魔王和勇者的话题，但最后众人也没有对于魔王的品格问题达成一致。随后花梨和樱等人聊到了教科书上的小说节选《心》，牡丹对于小说的句子记得十分清楚。之后大家又谈到了金太郎的故事。归宅部的生活就这样又过去了一天。

归宅部玩起了踢罐子的游戏，而牡丹却总是会把罐子踢到找不到的远距离。原来在玩踢罐子之前大家在部室玩游戏而樱被排除在外，樱才提议玩踢罐子，但牡丹总能把罐子踢飞。这天，归宅部的各位玩起了Guilty Judge，电视上出现了带着面具的樱，而真正的樱则在装死。几人在面具的指使下玩起了抢椅子。牡丹的敌对家萩调流四天王每周都会开会讨论新的对策，但是似乎四人对牡丹都抱有好感。

克蕾雅和牡丹陪花梨去交材料，归宅部内只剩夏希和樱，樱提议两人玩使用禁词卡的成语接龙，即夏希和樱各自在卡片上写下单词且不能让对方知道，该单词就是游戏中的禁词，一场语言大战正式开始，樱从容接词，夏希也绞尽脑汁使用“返还”“对抗”等策略加以发还，最终樱踩中“地雷”输掉比赛。花梨等人回来后，大家开会为夏希的生日派队出谋划策，没人在意坐在一旁的夏希，生日当天，夏希又收到了什么惊喜？

某日，樱看到有人在街头贩卖诗歌，头脑一热便召集大家一起写些诗歌去贩卖，可在樱错误引导下，大家写出的诗句意外的不靠谱，但即使贩卖诗歌计划搁浅，大伙儿还是从把写有诗句的签名板当飞镖玩的游戏中找到乐趣。得知夏希有一个弟弟后，樱等人便表现出浓厚的兴趣，一起相约去夏希家留宿，在被弟弟吐槽后，归宅部的各位又开始一脸严肃的研究起夏希的呆毛。

樱提出强化合宿的要求，可不得不面对选择去哪里的究极问题，口味选择、游戏里妹子的选择等乱入讨论过程，最终在夏希提醒下回归正题，将香川定为合宿地点，渡过海洋到达香川后，部员们开始了消灭乌冬面的活动，夜晚对着满天星辰大家展开了各种不靠谱的想象。合宿结束后，克蕾雅包下游泳池和大家一起消暑，期间又引发了一系列对“自由”的联想。

樱因自己的双马尾形象而改变内在属性，但“傲娇樱”并未得到大家的好评，以此为由归宅部的各位展开了形象与内在的讨论。樱号召大家参加社团接力赛，为赢得练习场地，归宅部和足球部进行球赛，由于牡丹的气势，足球部甘愿服输。在接下来的正式接力赛中，归宅部赢得第一，得知花梨没有参加比赛，夏希满脸恐惧，为什么原本五人参加的接力赛却能顺利进行？

憧憬高中社团活动的樱并没有发现吸引自己的社团，就在想要建立社团时想到了牡丹，樱的主动接近让牡丹手足无措，但是同为花的名字让两人紧紧联系在了一起，这就是归宅部的建立。决定在学校走廊玩保龄球的众人刚刚纠结完边沟的事情，背后便传来了很强的杀气，有着kousoku之名的学生会会长出现了。在这之后大家一起讨论在最终话应该做些什么，但她们漫无边际的幻想却让人跟不上步调。

花梨上课酣睡梦魔王，下课又和夏希讨论虫子大小的问题。爱和花梨组成了一个爱花梨组合，给夏希表演小短剧搞笑节目，虽不搞笑但也槽点满满。最终话里小樱也大展歌喉，只是这个唱功是不是让人有点…… 归宅部欢乐中二的故事就要完结了吗？当然不是，即使完结也并非结束，各种记录仍在轮番上演。