由于第三次世界大战，战斗特化的“战术人形”在未来普及。大规模军事企业“铁血工造”的战术人形突然对人类掀起叛乱。隶属民间安全承包商“G＆K（通称格里芬）”的战术人形“M4A1”等人组成的AR小队，接受机密任务潜入了敌阵，但在那出现的是铁血的战术人形“代理人”。

M4A1虽面对铁血的代理人后取得胜利，但格里芬的支持小队却遭到全灭，也和同伴各自分散了。同时，于格里芬前线基地刚到任的新人指挥官，简缇娅结束了首次任务，并与人形们交流加深了感情。但此时铁血的新刺客稻草人出现，宣告了平稳时光的终结。

I.O.P公司技术开发部16Lab的主任研究员帕斯卡，她所提出的M4A1救援请求被上层派给了简缇娅，她向M4A1可能在的地方派遣了战术人形。同时，M4A1为了达成任务并救助AR小队的同伴，在孤立的同时仍持续隐匿，但她遭遇了铁血的高级人形刽子手。

在激战的最后，M4A1成功击破了刽子手，并成功和同伴取得联系，但对她难以想像是前线基地的氛围而感到困惑，也无法控制想去救出同伴的想法。简缇娅表示要以保障安全为优先，以顺利完成作战。但并未发现ST AR-15的身影，另外再会的M4 SOPMODII揭示了新的敌人。

击退铁血后，M4 SOPMODII请求救出ST AR-15，但简缇娅不允许再次出击，因而大失所望。在这样的状况下，出现在执行侦察任务的战术人形面前的是高级人形猎手，以及被压倒性地数量的铁血固守的据点。焦急地想进行救出任务的M4A1等人面前发生了骤然剧变。

成功压制铁血的据点后，M4A1等人和ST AR-15再会。简缇娅收到高层指派掩护特殊小队的任务，让战术人形出击后发现地点是在与AR小队有着因缘的S09地区。在和铁血的激战中收到M16A1的通信，虽然确认她没事而放下了心，但有人随着降下的雨悄悄地接近M16A1。

依据通信纪录，M4 SOPMODII等人袭击了铁血的据点，但那是铁血的头目干扰者所设下的巧妙陷井。战况渐渐被逼上了绝境，简缇娅下定决心进行反击攻势，M4A1等人终于抵达最后的舞台。但那也是由干扰者准备周到的陷井。

和M16A1会合的M4A1等人成功打倒干扰者，AR小队再次恢复行动。即便对身为精英部队的AR小队感到疑惑，简缇娅仍窥见到了M4A1等人的日常，但她也在此时收到了招集命令。她前往机密据点和同僚们加深了交流，但事态却急转直下。

M4A1等人为了拯救机密据点潜入铁血的据点，收到了来自破坏者的通信。AR小队回去和简缇娅会合，等待着她们的却是ST AR-15被怀疑是内鬼。即便担心因为调查被束缚的ST AR-15，仍然追捕着破坏者的M4A1等人收到了震惊的情报。

为了解决现况拼命追捕的破坏者的AR小队，等待着她们的是梦想家为了引出M4A1的陷井。为了守护AR小队，上层给出了指令，简缇娅等人被迫做出苦涩的抉择。但也有人不因这个情况放弃，下定决心共同前进。

格里芬派出的内盖夫排寻找逃跑的“STAR-15”，遭到新型高端机型“炼金术士”和大量铁血的袭击。已经开始拯救被敌人的新武器分裂的女孩的AR小队，以及被迫再次做出决定的让-席安。而在战场的后方，有一道影子正在接近“M4A1”。

重聚的“ST AR-15”和“M4A1”进行了奇怪的对话。战场上，内盖夫排被“炼金术士”的阴谋逼到了墙角。在烟雾缭绕的少女前线，让-席安承受着越来越严峻的形势，但仍然相信并继续抵制战术玩偶。一声枪响在那儿回荡。