神城麻郁是一个靠写程式打工赚钱，并且自己租下一间湖畔小屋独自生活的高一学生。这一天在上学途中，麻郁遇见了两位少女，一个是留著一头绿色长发，乖巧内向的小野寺桦恋；另一个则是有著红色短发，活泼外向的宫藤深衣奈。此时的麻郁并不知道，这两位少女将会为他的人生带来翻天覆地的转变……

麻郁在不得已的情况下，只好留深衣奈与桦恋在家里住了一晚。隔天早上，三个人看著那张照片，心中都浮现一个疑问：「为什麼上面只有两个人合照的相片，却是三个人同时拥有呢？到底深衣奈与桦恋两人之中，哪一个跟麻郁才是双胞胎？」带著满脑子的疑问，麻郁匆匆匆忙忙出门上学，不料却把书包忘在家里没带……

深衣奈与桦恋就这样住进了麻郁的家，而且在麻郁的提议之下，两个人开始分担家事，并且直接以名字来互相称呼。不过，深衣奈发现自己似乎渐渐喜欢上麻郁，甚至连在梦里都会想著他；而桦恋看到深衣奈这个样子，心里也开始觉得不是滋味。就在这时候，心里也喜欢麻郁的织部椿突然来麻郁家拜访，一场风波即将发生……

深衣奈与桦恋认为不能光靠麻郁一个人赚钱，因此努力在找可以打工的地方。看到她们两个这麼努力，麻郁心里暗暗高兴，於是也向朋友们探听打工的机会；只是没想到，深衣奈和桦恋找工作竟然找到麻郁的学校来了。看到麻郁跟椿学姊这麼亲密的靠在一起，深衣奈忍不住就……。她们两个会惹出什麼麻烦呢？能顺利找到工作吗？

深衣奈与桦恋两人开始了与麻郁的共同生活。白天她们认真的准备著转学考试，傍晚则是两个人一起在缘川商店打工。顺利转入麻郁的学校之後，深衣奈与桦恋在学校听到了关於麻郁的种种传言。什麼！麻郁有那种倾向？为了让麻郁重新成为正常的男孩（？），於是她们两人拟定了作战计画。关於麻郁的传言到底是什麼？而她们两人的计画又能否成功呢？

深衣奈、桦恋都跟麻郁接了吻，三人之间弥漫著一股不同以往的气氛。停学中的麻郁，重新思考著自己为何来到这个镇上，以及三人之间的关系。至於深衣奈与桦恋两人，也各有各自的想法；深衣奈决定装作什麼事情都没发生，而桦恋在听到麻郁的决定後则是难过地哭了…。在浴室里，深衣奈与桦恋两人互相坦白自己的心情，也就此决定组成恋爱同盟……

由於知道彼此都喜欢麻郁，深衣奈与桦恋进而组成了恋爱同盟。这一回，因为麻郁幸运地抽中了冲绳旅游券，於是三人便一起来到了冲绳。相较於後悔没有兑换成现金的麻郁，深衣奈与桦恋则显得相当高兴；只是没想到在冲绳的海边，居然遇见了森野莓还有瑞穗老师等人。对於一心想制造只属於三人回忆的深衣奈与桦恋而言，这实在是出乎意料的发展。

不单单只是在家里，就连在学校，深衣奈跟桦恋也和麻郁在一起吃饭。在学生会会长(森野莓)的协助下，副会长(织部椿)利用筹备球类大赛的名义，让自己获得跟麻郁单独相处的机会。深衣奈与桦恋非常不愿意麻郁跟别人独处，但因为自己平常也必须在缘川商店打工，所以监视麻郁的工作就落在马利耶身上。原本一切都平安无事的进行著，不料後来却发生了意外，麻郁也因此得知了康生与副会长之间的过去。

球类大赛的日子终於来临，不料大赛当天却突然下起雨来，赛程只好临时取消，麻郁这些日子以来的努力也因此化为泡影。然而，就在大赛宣布取消後没多久，天气竟然马上放晴了，麻郁为此郁闷到没心情工作，於是就听深衣奈的建议三人一起去逛街。原本一切都好好的，但是途中却因为一些突发事件，使得三人在阴错阳差之下走散了；交错在街道与人群间，三个人的心情也同样复杂交错……

也许是发生过什麼不愉快的事，所以深衣奈直到现在，都没有将自己的过去告诉麻郁跟桦恋。某日上学的途中，深衣奈意外地与国中时期的同学社裕香重逢，也因为这意外的重逢，使得深衣奈心中有些东西开始动摇、变化。无法诚实面对过去的深衣奈，最後选择到小熊山上逃避，後来被瑞穗老师发现。究竟深衣奈以前发生过什麼事情呢？瑞穗老师又能否让深衣奈鼓起勇气面对过去？

桦恋在对面山上的废弃屋里发现了一本日记，里面有一张跟麻郁、深衣奈、桦恋三人手中一模一样的照片。从那本日记中，桦恋得知一个重大的秘密，那就是真正跟麻郁有血缘关系的人，就是桦恋自己。桦恋在知道真相之後，决定先在约会中向麻郁告白，然後再把这件事情说出来让大家知道。然而深衣奈在知道事实之後，似乎受到很大的打击，一个人悄悄地收拾行李离开了……

离家出走的深衣奈，隔天却若无其事的出现在学校，只是她的行为举止变得跟以往有点不同，那就是完全不跟麻郁说话。桦恋趁著与深衣奈独处时，重新询问了她的想法，才知道深衣奈一直躲避著麻郁的原因是……。不过，这番谈话也被一旁的瑞穗老师、小苺、椿以及晴子等人听到了；随後又传出深衣奈即将离开这个小镇的消息，究竟麻郁与深衣奈之间的关系会变成如何呢？

麻郁跟桦恋是真正的双胞胎这件事揭晓後，转眼已过了两个星期。谁知道桦恋却像是变了个人似的，每天都黏著麻郁不放，使得麻郁无法专心工作。麻郁在无计可施的情形下，只好去找康生与椿商量，他们两人想的方法是在神城家附近搭个帐棚，叫麻郁一个人住在那里，这样一来不但可以专心工作，也不会离家太远。只不过，麻郁隔天起床後却发现深衣奈、桦恋、瑞穗老师等人都……