圣凤学园敢达模型对战部的部长星野文奈心急如焚。只剩下文奈一人的对战部无法参加三人一组出赛的全国敢达模型对战锦标赛中等部组别。在文奈面前出现了一位转校生。转校生名叫神木世海，是使用称为次元霸王流的拳法的拳手。文奈马上请求他加入对战部。世海在操作偶然间寻获的大魔时，被敢达模式对战的魅力所吸引。这时，尝试招揽文奈的模型部部长宫贺大树出现并要求对战。虽然是初次对战，但世海使用次元霸王流将宫贺的机体击倒。此时，文奈的青梅竹马，年轻天才制作家高坂佑马使用闪电敢达介入战场。

转入圣凤学园的世海找到同班的佑马，并邀请他加入对战部，但却被佑马毅然拒绝。此时，学园学生会劝说对战部和模型部合并。为了让对战部继续保留，必须和模型部对战并胜出。对战的对手中也有佑马。虽然被迫在三对二的不利情况下对战，但对战部在文奈的战术下取得优势。心急的宫贺使用巨大的MA亚格利沙，并把文奈逼上绝路。佑马不认同会长为了胜利而漠视事前决定的对战规则，于是和世海夹击，将宫贺的亚格利沙击倒。在佑马的加入下，队伍Try Fighters终于成立。

本以为转而加入敢达模型对战部会困难重重，谁知却一帆风顺。虽然大感意外，但佑马终于都成为对战部的会员。因为佑马的加入，文奈终于获得敢达模型对战锦标赛的参赛资格，她立即请求顾问完成报名申请。面对即将来临的大会地区预赛，世海他们努力进行对战训练。这时对战部的顾问提出练习比赛，对手是圣敖德萨学园的队伍北宋之壶。她们是去年地区预赛四强之一的高手。此队伍的队长佐崎薰子因为喜欢使用强人型的机动战士而被称为「强子」。在许多观众的注视之下，Try Fighters的首场团队战终于开始。

在和强子对战的练习比赛中初次胜出后，Try Fighters为了迎接一个月后的地区预赛而积极训练。这时文奈因为制作锦标赛用的机动战士而烦恼，故找拉尔先生商量，拉尔先生便提议她和世海一起去G缪斯。因为文奈沉溺在敢达模型的抉择之中，无所事事的世海便在店员的推荐下，首次制作敢达模型武者号斗丸，并和小孩子一起对战。当文奈和世海会合时，大阪首屈一指的中学生制作家阪井凑出现。凑在一瞬间将荒鬼顽驮无制作好，并和世海对战。对SD机体特性十分了解的凑使世海陷入苦战，继而大败。但是通过这场对战，世海和文奈却获得了关于锦标赛的重大启示。

在与阪井凑对战之后，世海和文奈明确了各自的目标，并为了锦标赛而开始行动。与此同时，佑马为了达成与文奈的约定，为闪电敢达制作强化装备。其他选手也同样在为地区锦标赛预赛而准备着。每个人都把各自的期盼藏于心中，迎接全日本敢达模型对战锦标赛初级组别西东京大赛的开幕。文奈在比赛首日刚好完成了凯旋敢达，在她的带领下，世海和佑马也为了这一天作好准备。经过抽签，Try Fighters的首战被安排于首日的第3场赛事。为了展示一直以来努力的成果，Try Fighters终于开始挑战全国大赛！

Try Fighters为成功胜出第1场锦标赛预赛而举杯庆祝。正当其乐融融时，第2场赛事的对手也定下来了。对手是热门夺标队伍之一的强校，成练高职。无论对手使用什么战术，他们也能一一看穿并将其击败…仿佛战场被成练统治一般。在比赛前夕，文奈叫世海和佑马前往活动室，在那里文奈向他们展示凯旋敢达隐藏的必杀技机能…虽然Try Fighters在准备充足的情况下迎来了第2场比赛，但成练高职的3部Ez-SR既清楚对手的机体特性，也将对手的性格一一掌握，并且专攻Try Fighters的弱点！

Try Fighters在接下来的第3场比赛中借着战胜强校，成练高职的势头乘胜追击，而对手的自我毁灭也助了一臂之力，他们最终得以胜出。运势当旺的Try Fighters继续向四分之一决赛进发。为了探查下一场的对手，文奈一行去观看接下来的比赛。最终胜出的常冬中学队伍尽管用的是素组的敢达模型，但凭借着天生的操纵技术而打败了常胜热门队伍。赛后，常冬中学的队员为了和不治之症做抗争的，队长饭纲西门之弟，小守，而恳求文奈等人让赛，让常冬中学获胜。文奈他们为突然而来的恳求而为难，同时也因质问自身的战斗意义而头痛。世海为了弄清真相和自己的心意，只身一人前往西门弟弟所住的医院。在那儿，世海向制作敢达模型的小守以及比赛对手的西门，堂堂正正地宣战。

Try Fighters终于来到了只剩四强的半决赛。通过抽签，最终的对战组合确定了，分别是Try Fighters对战水龙学园，强子的圣敖德萨学园对战宫里学院高中。似乎是因为受到要对战去年的优胜学校的压力，强子向世海诉苦。由于文奈的好意，强子得以和世海两人单独留在快餐店，实则这是强子为了博取世海同情，促使他许下约会承诺的一次作战计划。虽然她表现得温婉柔弱，但仍然被世海识破而以失败告终。而恰逢宫里学院高中的阪下与须贺也在场，须贺随即向偶遇的世海喊话道「次元霸王流拳法对我是没有用的。」分别之际，世海与强子约定「决赛上见」，并向半决赛进发。

Try Fighters的决赛对手确定，是去年地区预赛的优胜学校，宫里学院的队伍G大师。双方把各自的决心和意念埋藏于心，挑战决赛。决战的战场是宇宙要塞所罗门。正当须藤操作着由心形流阪井凑所制作的百万式和佑马的闪电敢达在要塞外的宇宙区域打得难解难分之际，世海和文奈也在要塞内遇上事先埋伏的须贺等人，并展开战斗。两方旗鼓相当，打得火热，期间佑马成功阻止须藤以超级米加粒子炮攻击由要塞出来的世海和文奈，并和他同归于尽。纵使已打至伤痕累累，但从没放弃过胜利的世海和须贺仍拼尽最后一分力战斗到底。当世海带着文奈与佑马的意念，与创制燃焰敢达化为一体时，红莲之火炎顿时燃烧起来！

Try Fighters胜出了全日本敢达模型对战锦标赛西东京预赛。世海也从同化现象的伤害中恢复过来，并对聚集了未曾谋面的强敌的全国大赛充满想象。在这期间，作为时装模特的世海姐姐，神木未来顺理成章参加了融合敢达模型和时装，通称「敢达收藏」的「东京敢达模型收藏」 当中的重要环节，模特公司敢达模型拉力赛…未来在世海和佑马的帮助下，成功制作出妈妈熊霸。在「敢达收藏」当日，世海等人在精彩纷呈的时装表演结束后，到后台探访未来。知名摇滚乐队「第三代魔蟹」的领队阿拓突然现身，而在世海的决断下，未来不明所以地以和阿拓约会为赌注，要和他决一胜负。

期末考试结束后，Try Fighters为了迎接在暑假中举行的全国大赛而进行集训。在拉尔先生的帮助下，他们来到了尼尔森实验室，这里聚集了全国大赛的常客队伍，而且这里的设施更是拥有业界最高水平的对战环境。世海他们在机缘巧合之下，在此地答应了跟当时正在使用对战装置进行模拟战的鹿儿岛代表，我梅学院的白狼队进行练习比赛。可是，Try Fighters却因为世海而迟到，就在这段时间内，白狼队却被单单一台敢达模型打败。佑马见到那台敢达模型后，突然闯入战场，并向其挑战。对于佑马突如其来的举动，文奈等都甚感惊讶，而那台敢达正是两年前令佑马退出对战的原因。

敢达模型学园的阿藤佐贺所控制的终结敢达将Try Fighters打得体无完肤。佑马在看到这悬殊的实力差距后倍感惊讶，留下世海他们，独自一人离去。文奈因为担心而把因同化现象而倒下的世海交给拉尔先生，然后去寻找佑马。而川口名人却出现在意志消沉的佑马面前。文奈发现佑马被名人二话不说以边车带走。而川口小姐也出现在她面前并忠告她「作为敢达模型制作家和战士，现在的你缺少一样十分重要的东西」。为了重拾失去了的信心，并探寻所缺少的东西，两位名人向佑马和文奈发出挑战！

在和阿藤对战中受伤的世海在康复之后，为了修理创制燃焰敢达而前往实验室的工作室，并在那里遇上神秘少女。因得到少女的建议而将创制燃焰敢达修理好的世海，在翌日为了特训而和拉尔先生一同去实验室的对战室。在那里神奈川代表，本牧学园的狩真启向世海要求进行练习比赛。当得知其目的是为了了解敢达模型学园的实力时，世海感到十分愤怒。在那里敢达模型学园的王牌木岛威弗里德以及鹿儿岛代表的我梅学院也介入，令事情一发不可收拾。此时，对战装置突然启动，川口名人也出现。在名人的安排下，以各校代表进行的大混战开始了。

在名人的安排下而进行的各校代表的大混战中，神木世海和木岛威弗里德互相将对方看成劲敌，并应允在全国大赛中再次对战。高坂佑马也向阿藤佐贺宣战，重新拾起对全国大赛的决心。另一方面，因为会场准备不足而延期，并成为最后一场地区预赛的大阪预赛，由阪井凑所属的天大寺学园创制暴风队胜出。在全国强手着手准备10日后的全国大赛期间，文奈他们也以打倒敢达模型学园为目标，把在尼尔森实验室所得的经验用于弥补自已敢达模型的不足之处，并着手强化。大赛日子不断逼近，在强子等人的帮助下，Try Fighters的新机体终于完成。

过往的敢达模型世界锦标赛在PPSE体育馆举行。因为7年前的帕拉夫斯基粒子失控事件，而损毁的体育馆被拆除，如今设立了刻有历届冠军名字的石碑。而在遗址附近新建的矢岛体育馆，将会举行全日本敢达模型锦标赛。当胜出全国预赛的各都道府县的强者齐聚一堂，世海重遇敢达模型学园的木岛威弗里德，并声援他。另一方面，佑马也发现了阪井凑将会以大阪代表的身份参加大赛。翌日，在开幕礼后的配对抽签中，文奈他们的Try Fighters抽中大赛的第一场比赛，立即要进行对战。对战对手是去年全国大赛的八强队伍，南北海道的代表鄂霍次克学园！

大阪代表，天大寺学园的阪井凑一行人操作奇特的敢达模型泰伦3，以压倒性的力量轻易突破大赛的第一回合比赛。世海他们在尼尔森实验室所遇到的劲敌，包括鹿儿岛代表我梅学院和新潟代表统立学园都顺利通过第一回合的比赛。大赛进入第二回合，种子学校的敢达模型学园终于出战。敢达模型学园的第三名战士，是曾指导世海修整创制燃焰敢达的木岛西亚。在众人的关注之下，敢达模型学园和神奈川代表本牧学园进行对战。但由于西亚在最后一刻才完成敢达模型，作为惩罚，木岛威弗里德命令西亚一人独自作战。西亚要操作恶兆敢达，单独一人与本牧学园对峙。

Try Fighters的大赛第二回合的对战对手是新潟县代表统立学园的队伍SD-R。他们是使用SD敢达、以完全分析对手的情报后制定精密战术的三兄弟，并且通过兄弟间的巧妙合作在大赛中百战不殆的强敌。劲敌们都在观看的对战终于开始。Try Fighters一边戒备对战对手的攻击，一边探索巨大的幽灵城。但是由于佑马出乎意料的弱点让Try Fighters中了敌人的策略，令队伍分散了。为了会合世海他们而向地下进发的文奈，却因事先设下的计时炸弹陷阱被困在通道中。另一方面，掉进地底的世海二人因为敌人可以吸收帕拉夫斯基粒子的吸收系统令机体不能自由活动，身陷险境。

志木彻为报复敢达模型学园而制作的史耐霸‧龙‧吉拉，利用吸收系统从世海他们那里夺取粒子变成自己的火力，再加上他们的巧妙战术，令Try Fighters身陷险境。虽然受到敌人猛烈的攻击，但Try Fighters利用世海制造的机会，成功逃出幽灵城，并开始反击。在战斗中，世海感受到彻是心怀着对敢达模型学园的怨恨在进行对战。为了解开怨恨，世海用尽全身的力量，使出发动了燃焰爆轰系统的一击。Try Fighters几经辛苦终于胜出第二回合比赛，但各机体都受到严重的损伤，而由伊织诚所制作的TRY燃焰敢达更是无法完全修复。就在这个时候，佑马收到姐姐千奈的联系。

从姐姐千奈那里拿到创制燃焰敢达的备用零件后，佑马返回宿舍，途中却遭遇流氓拦截。就在佑马挺身保护零件之际，世海等人及时赶到，制止了暴行。川口名人唤出躲在树阴下观看整件事的家伙。而出现在他们面前的，是曾经和世海以及未来一起修炼次元霸王流拳法的师兄井濑纯也。对于这意想不到的重逢，世海无法隐藏心中的不安。他不明白那位曾经心地善良的纯也为何会使出如此卑劣的招数。其后他从未来那里得知纯也已经登记成为他们八强赛事中的对手，宫城县代表天山学园的候补成员。世海为了确认纯也的真正意图，寄意于拳头中，开始八强挑战赛事。

在全日本敢达模型对战锦标赛的八强赛上，同样都身怀次元霸王流拳法的神木世海和井濑纯也展开激烈的同门决斗。为了打破僵局，世海虽然启动了燃焰爆轰系统，但纯也同样也启动了燃焰爆轰系统，连世海自创的敢达模型原创招式也被化解。单纯而认真地想变得更强的世海所要面对的纯也，却执迷于终极强悍，为了满足自己的欲望而追求强大的极限。背道而驰的二人将自己的信念和想法寄托在拳头上进行激斗。但是经验的差距和纯也卑鄙的攻击令世海陷入危机之中。当世海因同化的反作用所产生的剧痛而慢慢失去意识时，却被不可思议的光辉所引导。

全日本敢达模型对战锦标赛的四强选手齐聚一堂。半决赛的对战组合抽签仪式正式开始。第一回合是由木岛威弗里德率领的静冈县代表，私立敢达模型学园对拥有欧洲少年组冠军头衔的卢卡斯涅墨西斯所属的德岛县代表，格兰纳达学园。而第二回合则是神木世海他们的圣凤学园初中部对阪井凑所在的大阪代表，天大寺学园。在比赛前，各队队员都因为世海而互相擦出火花。在漂浮着浮游大陆的战场里，私立敢达模型学园和格兰纳达学园的第一回合比赛终于拉开帷幕。卢卡斯操作骷髅敢达X1全武装，和敢达模型学园的对手展开一对三的战斗。

全日本敢达模型对战锦标赛半决赛第一回合在激战过后，由私立敢达模型学园险胜。战败的卢卡斯涅墨西斯因为不能在决赛和世海一战而向他道歉，并说道「我先走一步，在那边等你」，然后离去，好像预见会和他在世界的舞台重遇而为他加油。另一方面，天大寺学园的阪井凑出现在佑马和文奈面前，并向他们宣战。文奈不明白凑为何会单方面敌视佑马，提出质疑，凑借机将一直以来对佑马累积起来的想法一吐为快。在得知了凑的想法之后，佑马向凑诚心道歉，并向他表达自己的决心。一心想要取胜的Try Fighters和创制暴风两队的第二回合半决赛正式拉开帷幕。

最终闯进全日本敢达模型对战锦标赛中等部组别决赛的分别是几经辛苦战胜阪井凑所在的创制暴风队的Try Fighters，以及私立敢达模型学园的天人领域队。为了备战两日后举行的决赛，两队都开始修理在半决赛中受损的每一台机体。在此期间，Try Fighters在拉尔先生的提议下进行简报。曾在大赛第二回合交过手的新潟县代表统立学园将敢达模型学园的战斗方式等详细资料记录下来并发送给他们。看过资料之后的佑马一边修复机体，一边苦恼着……这样下去，就算修复好，也无法缩小和敢达模型学园之间的实力差距……深信会如此的佑马决心要在决赛前所剩无几的时间内，将所有机体进行完全改装。

全日本敢达模型对战锦标赛决赛终于开始。Try Fighters先行一步，选择在宇宙殖民星内作战，世海、文奈以及佑马兵分两路，做好准备迎击敢达模型学园。观众都紧张地观看着这场寂静开场的决战。而打破沉寂的是木岛的瞬变敢达。他看穿了世海等人的作战，使出威吓攻击以牵制他们。而差不多在同一时间，佑马与西亚、阿藤也开始战斗。在这场称得上为一进一退的死斗，上演激烈攻防战期间，佑马、文奈，和敢达模型学园的阿藤及西亚同归于尽。剩下来的世海和木岛虽然损伤严重，却仍拼死作战，但最终超过时间限制，要进行大赛首场延长战。

全日本敢达模型对战锦标赛决赛以Try Fighters的胜出落下帷幕。但世海却突然在决赛后踏上修行之旅。几天后，敢达模型制作家大赛「名人杯」正式举行。为了以敢达制作家的身份和小凑一分高下，佑马和拉尔先生一起到达会场和文奈会合。曾在地区预赛和全国大赛对战过的对手们全都齐聚于此。名人杯的颁奖礼开始，佑马的作品荣获公开组的优胜。正当文奈为佑马得奖而高兴之时，出外修行的世海也回来了。另一方面，小凑因不满评审结果而提出抗议。名人接纳了他的抗议，于是开启敢达模型对战的战斗装置来让二人再分胜负。