取回50年前被称为“妖刀的力量”的雷欧帕尔德，变成了“黑暗王子”（prince of darkness），发射反物质炮向Nerval攻击，Nerval马上陷入下风。驾驶QT-arms前往Nerval的秋叶在Nerval头脑室和妹子相会，但因为雷欧帕尔德攻击的关系，秋叶和妹子再次分开。而后，秋叶遇到了奈美。面对世界再次剧变，奈美决定毁灭世界，高举锡杖先拿秋叶开刀。奈美准备攻击伊月和穗乃香时，秋叶用黄金枪射击奈美，触发了奈美的Anti-QT之力，阿蕾达（=神月）和8名Existent-Z的洗脑被解除。Existent-Z不再接受奈美的命令，受到打击的奈美离开。返回kirkwood殖民星，神月告诉秋叶“穿越宇宙的少女”的含义，那是作为结束跟智能殖民星战斗的存在。接受命运的秋叶，风音告诉她要“杀死雷欧帕尔德”。烦恼着的秋叶想起了妹子直到最后还是守护着自己，于是下定了决心。另一方面，奈美自称“穿越宇宙的少女·BLACK”跟“黑暗王子”雷欧帕尔德联手，声称要清除人类，向地球发射反物质炮摧毁狮子堂岛。