想成为女孩的男孩子·二鸟修一，与想成为男孩的女孩子高槻佳乃。在小学相遇，知道互相的秘密的两人，互相讨论着共同的烦恼，并成为了不可替代的存在。然后，春季到来。迎来了初中的入学礼，虽然对不习惯制服的触感而困惑，但对新生活的期待和不安加剧的两人的目光，被穿着诘襟来上学的女孩子·更科千鹤的姿态所吸引。

初中的新生活开始了，佳乃和沙织，因为修一的事情而在小学的时候失和以来，一直持续着尴尬的关系。同时，去社团活动的临时入社时间开始了，佳乃和千鹤进了篮球部，而沙织和佐佐进了排球部。夹在两人之间，左右为难的事情变得更多了的佐佐，也烦恼不尽。那样的沙织，因为无视打招呼而被高年级生盯上。

在班里文化祭的准备开始，1年3班多数的结果决定了，是沙织的提案，男孩演女孩，女孩演男孩的“反串剧”。由于佳乃的推荐，修一开始写舞台剧的剧本，不过沙织也在写着剧本，在班主任税所老师的提案下，合并为一个剧本。另一方面，从篮球部的顾问口中，被提醒要穿文胸的佳乃，对自己无法掩饰的身体的变化而感到困惑。

修一和沙织正做着文化祭的反串剧的剧本作业。但是，两人的心情不由得交错起来，不简单的作业也没有进展。沙织说修一的剧本是“修一的愿望，即想被佳乃深爱着他女孩子的一面”。另一方面佳乃让雪请教她买内衣，并邀请修一来一场久违的女装&男装的约会。被沙织说自己的心情自己知道的修一，对佳乃说出那个想法，但……

暑假开始了。修一等人在沙织的家里聚在一起，大家都埋头于反串剧的剧本制作中。在此之中，由于偶然来到沙织的家的文弥的发言，修一时常穿女装的事情被千鹤等人知道了。千鹤津津有味地对修一进行质问酷刑，佳乃对此发脾气然后回去了。佳乃为了自己而生气而感到开心的修一，对佳乃的心情，这次的事情就告一个段落。

终于等到了文化祭的当天。修一等人的班级正忙着准备舞台剧。扮演朱丽叶的诚，对着罗密欧的衣装穿得非常合身的沙织，自己没能拿出自信。正式演出正一分一秒地迫近中，为了缓解紧张大家都进了鬼屋。当天雪和小信也来参观，显得文化祭非常热闹。然后，终于1年3班的反串剧“罗密欧与朱丽叶”揭开了序幕。

某天早上，修一对鼻头上长出了个青春痘而感到在意。真穂嘲笑道“以后会长出更多的”。修一心想着早日治愈而奋斗，但是过程中痘痘又增加了。以安那的交谈为契机，商量着各种各样的事情，以前不擅长与安那交谈的修一，现在与她变得亲密了起来，并注意到了现在为止不同的情感开始萌生。那时，修一和沙织共同制作的文化祭反串剧的剧本被赏识，被戏剧部挖墙脚。

季节轮回，春天又到来了。修一等人都升到了2年级，一直向学校请假好久不见的纱织也来上学了。大家都很愉快，但新学期马上就换班级，修一与小学的时候讨嫌的土居同一个班级。另一方面，佳乃这回也被穿着诘襟来学校的千鹤所感触，便决定踏出新的一步。那时，修一被真穂警告，与安那交往的话就不要穿女装，烦恼之后，对安那表明“喜欢穿女装”的隐情。

终于决定要穿着男生制服来上学的佳乃，对四周的反应有点害羞，不过习惯了以后就没那么担心了。对那样的佳乃，修一稍微感到有点羡慕…。同时，修一没有拒绝对雪一见钟情的土居，为了与雪见面的请求。知道雪原来是男人这事后，土居惊呆了，但同时，对修一穿上女装会怎样产生了兴趣。次日，土居对修一说想看他穿女装的姿态。

修一穿着水手服来上学以来，变得不能去学校了。真穂也拒绝去上学，修一对自己的行动感受到了责任。受到了佳乃的信的修一好不容易决定回校，但是被同学们针对女装的事情而戏弄，土居也连招呼也不打，进不了教室只能去保健室上学了。那时，修一的班级在文化祭的演出节目成了“反串剧”。

成为文化祭反串剧的剧本担当的修一，一直在保健室上学，舞台剧的练习时才露脸。土居对修一的剧本加了即兴发挥的内容，但是意外地受到好评，修一下定决心想拜托土居帮忙制作剧本。另一方面沙织，邀请很久不见的修一与佳乃到自己家里，像小学生的时候请他们穿着女孩子的衣服。那时虽然无法回到过去，尽管如此。修一一边看着沙织的连衣裙，一边呆呆地考虑着那样的事。然后终于，文化祭的日子到来了。