进入新越谷高中的武田咏深，与在旁边的座位上超喜欢棒球的川口乃芳、以及双胞胎姐姐息吹成为了好朋友。但咏深打算放弃棒球，然而入学仪式之后，与童年小伙伴的山崎珠姬再次相见。珠姬已是一名成熟的捕手，在伙伴的鼓励下，咏深终于投出了“那种球”。

咏深等人和同样是一年级学生的川崎稜和藤田堇向棒球部提出入部申请，得知棒球社因丑闻被迫停办，据说两位2年级学姐为了避免棒球社被废除仍然保留着社员的身份，当两位学姐来到棒球场后，咏深提出了让她们留在棒球社的赌注。

在恢复了活力的新越谷棒球部，有2名1年级学生参加了体验社团。其中一人是在福冈的强队中村希。还有一个是棒球初学者，但是有剑道全国优胜经验的大村白菊。两个人都在当天成为了棒球部的一员，队伍所需要的人数终于凑齐了。“以全国为目标！”在咏深发出声音的同时，珠姬也不知为何露出了复杂的表情。

藤井杏夏作为棒球部的顾问就任，马上组织了练习比赛。迎战的对手是今年夏季大赛的备受瞩目的队伍·柳川大附属川越，而最先上场的是2号投手大野彩优美。新越谷先得3分的话，咏深·珠姬的电池也会让先头击球员三击未中。在第2回表中，新越谷被三者平退压制的时候，柳大川越的2年级王牌朝仓智景终于到了学校。

黄金周在学校进行集训的新越谷99。从第一天开始就对预想不到的杏夏的猛烈敲门声叫苦不迭，另一方面，在新越谷感受到了投手的必要性的芳乃看清了成员的投手适当性。那天晚上，怜向假装不知道的理沙打招呼。回顾去年成为停赛部，中学时代相遇时的两人，理沙继续打棒球是因为意外的理由。

和守谷榉台的练习比赛。正如在合宿中芳乃告诉的那样，4号是希。没能提高打分而烦恼的希，在第一集就打出了适时的安打。一口气取得了6分的背面的守护，用珠姬的建议封印了“那个球”的咏深虽然招来了危机，但是杏夏的敲门和芳乃的分析被生存了的背部的守备帮助。但是，守谷欅台的投手也重新站了起来，在一步步地被追逼的情况下，比赛迎来了最后阶段。

参加夏季县大会抽签的怜和芳乃。因为丑闻而停办的新越谷的名字一提到会场上就会有不稳定的气氛，但是在柳大川越・大野的帮助下得到了平安无事。抽签结果显示，第一场比赛的对手是影森高中，第二场胜利的对手是前年的优胜校梁幽馆高中。立刻进入以梁幽馆战为假想练习的咏深等人。另一方面，芳乃和呼吸前往没有数据的影森进行侦查。

县大会开幕日。珠姬遇到了中学时代前辈梁幽馆的投手吉川和美，看到了这一幕的咏深想要和吉川较量。在影森战中保留了艾斯的咏深，理沙登上了首发的投手台。虽然也有失误，但是靠先发制人得分了。

新越谷在影森的投手中山的低手投球中采用了良好的手法，摆脱了第六局的危机。那个背面的攻击，破坏了中山的步调。虽然是理想的比赛，但芳乃却责怪自己的指挥结果。

第二战梁幽馆战山脊和堇在对方的选手层和大拉拉队中畏缩不前，但咏深却没有气势。梁幽馆的队长中田奈绪看到这一幕紧张起来。初回，新越谷以怜的适时安打取得1分。在这背后的防守，咏深正是第一个击球手阳秋月才用“那个球”三击，之后在二垒设置了跑垒员，迎来了大会屈指可数的强打者中田。

梁幽馆的严守阻碍了新越谷得分。再加上运气不好的失误，在满垒的场面中，中田将迎来击球位置，而新越谷则决定敬而远之。虽然观众席上传来了不好的声音，但是咏深却展现出坚强的一面，全力投球的直球突破。无法打开突破口的新越谷和无法捕捉到咏深球的梁幽馆之间的攻防持续中，迎来了中田的第3击球员位置。

在领先球之后，新越谷再次从怜的三垒打逼近1分之差。其中，咏深也没有靠近梁幽馆的下位击球线，比赛以1分之差，终于进入最终回。前方的珠姬，接着的堇一起出垒的新越谷，梁幽馆宣告投手交替，投手土台上站着王牌中田。然后，4号希去了击球员位置。满怀着对同伴的思念而挥出的击球手的去向是——。