农大一年级新生泽木直保具有能看见菌的特殊能力。他发现学校某块地里不断喷出大量菌，而且学校里行踪不明的女学生长谷川遥的姓名牌正插在那块土地上，大骚动~~！！这时突然出现一个老人，他居然就是树庆藏！

日本酒的天敌火落菌大量出现！泽木揪出了在学校内私自造酒的犯人川滨和美里。私自造酒失败欠下大量现金的两人将怎样利用泽木的能力赚回酒馆的集资呢？

正在进行菌的培养的川滨和美里遭遇到有洁癖的及川，灭菌活动将发生怎样的波折呢？另一方面，树教授准备新建发酵仓并向大家演示了造酒过程，泽木的能力会带来怎样的影响呢？

树教授让泽木和结城去学校的学校B1农场里去偷蔬菜。今晚，入校的新生们第一次体会到了蔬菜小偷的感觉，而试验田里又有什么等着他们呢？

泽木看见了一个全身被菌包围的“菌怪”。在树老师的承办商日吉菊二的酒店里。菊二向大家介绍了日本酒深奥的文化，还劝解泽木对能看见菌的能力要心怀感激。就在这时一个浑身发臭的女人武藤葵出现了。

背着各种发酵食品的武藤从陆路回国啦，这位外形亮丽的女生就是深受农大男生们的欢迎的女神。但是，泽木发现武藤带回来的不止是发酵食物，还有病菌！农大中毒事件就此拉开帷幕…………..

由一个全身着黑衣的怪人集团农士会举办的农大春季庆典正式开始啦！完全体现农大精神的活动要求学生与校外隔绝，学校自给自足。连农士会都不清楚的谜样规则，春季庆典将怎样发展呢？

春季庆典最后一日，学生们对农士会开始了总攻击，想入手树教授发明的媚药的美里和川滨也决定利用农士会的弱点趁乱发起突袭。大乱战中泽木将怎样对阵农士会巨大的大将呢？

树教授又邀请大家一起品尝发酵食物了。而今天又是长谷川和父亲见面的日子，她父亲还是不放弃劝长谷川退学。怀着烦恼入睡的长谷川却不知道她面临着怎样的危急！

泽木在日吉酒店的门口见到一个哥特打扮的少女。再见少女时却被及川看见了惊人的一幕，他们居然在接吻！回研究室后泽木发现他的能力没有了，怎么会这样？是因为那个吻么？

美里和川滨还是和平常一样对待没有了能力的泽木。另一方面，泽木对长谷川的问题“要是一直看不见了怎么办”突然感到困扰。以好友萤倾诉烦恼的事作为契机重新凝视自己的人生的沢木，把自己的想法传达给长谷川。