虎杖悠仁是一位体育万能的高中生，某天他为了从“咒物”危机中解救学姐，而吞下了被诅咒的手指“两面宿傩之指”，让“宿傩”这种诅咒跟自己合而为一。

虎杖醒后，面前的咒术高专老师五条悟告诉自己“秘密执行死刑”已经决定了，但五条告诉虎杖有两个选择，要么现在就死，要么把20根“两面宿傩的手指”全部找齐后再死——。

虎杖、伏黑和五条在接完第3名高中一年级学生钉崎野蔷薇后，来到了一栋废弃大楼。五条告诉虎杖和钉崎前去进入废弃建筑里面把诅咒拔除掉即可完成课题。建筑内部，钉崎在与虎杖兵分两路后，与将小孩当成人质的狡猾咒灵对峙了起来。

由于少年院发生了紧急事故，虎杖、伏黑、钉崎被派去前往该处。任务是在解决掉等级已经达到特级咒灵的咒胎的同时寻找并救出仍然活着的生还者。

逃到少年院外面的伏黑感受到了特级咒灵的死亡，然而就在下一刻，两面宿傩突然来到了他的面前，并掏出了虎杖的心脏以此作为人质。

五条因为虎杖的死而感到不甘。因为同伴的死而感到心情沉重的伏黑和钉崎为了变得更强而和高二的前辈们开始了特训。另一方面，夏油他们也开始了行动。这时应该已经死了的虎杖却...。

移动中的五条突然遭受到了特级咒灵“漏瑚”的袭击，以重视进攻来决定胜负的漏瑚，即将见识到五条有多么强大。

正在为交流会而进行着特训的钉崎和伏黑遇上了咒术高专京都分校的禅院真依和东堂，两人来势汹汹地前来找茬，伏黑被东堂用胳膊推开，另一边因为对真依的话感到厌恶，钉崎随即与真依的战斗一触即发...。

从高中逃学到电影院的吉野顺平亲眼目击到了同年级学生身体变形而死亡的惨状，为了抓住“犯人”，吉野顺着声音的方向跟了过去。然后，来到变成案发现场的电影院的虎杖与1级咒术师七海建人遇上了2只咒灵。

虎杖和伊地知对吉野进行着调查作战，随后靠低级咒灵袭击吉野时候的反应来确认是否有问题的作战失败了。另一方面，七海正在与真人在地下水道互相交锋。

在真人追上并打算劝降七海的时候，七海解除了咒力限制并使用十划咒法“瓦落瓦落”将地下水道的墙壁破坏掉，使其碎片如雨般降下。另一方面，吉野与虎杖见面后，发现两人在电影方面非常聊得来。

真人利用了吉野，并教会他如何使用式神，然后吉野便和虎杖对战了起来。面对着为了复仇而暴走的吉野，虎杖在一拳一拳地档下进攻的同时伺机询问他到底发生了什么。从吉野的口中虎杖听到了残酷的事实，就在此时在两人的面前真人出现了——

千钧一发之际七海及时赶到挡下了真人的攻击，拯救了虎杖。为了彻底消灭掉真人，七海和虎杖商定由七海先上前进攻，虎杖则伺机发动进攻。而真人还打算用改造人来打击他们的心灵时，虎杖趁机发动了攻击。在遭受到两人穷追猛打的联合进攻下，真人感受到了“死亡”的气息......

从虎杖等人手中逃出的真人，与夏油等人汇合，打算推进某个计划。另一方面，咒术高等专门学校将举办“京都姐妹学校交流会”。伏黑和钉崎、二年级的真希、棘、熊猫集合在一起，东堂等京都学校的人们也到达了那里。马上在一触即发的气氛中，五条又迟到了，却也给大家带来了一个惊喜——。

京都姐妹学校交流会的团体赛开始了。京都学校的东堂率先向东京校的成员发起袭击，被任命为阻止其行动的虎杖也开始与之交锋。被东堂的力量压倒的虎杖，突然被东堂询问起了对女人的兴趣——。

东堂指出了虎杖的“径庭拳”是对特级咒灵无效的技能。面对坦率接受忠告的虎杖，东堂全力引导对方。另一方面，钉崎向京都学校的西宫挑衅。机械丸从背后向旁边的熊猫发起了攻击。钉崎和西宫，熊猫和机械丸的战斗开始了。

交流会的战斗仍在继续中......真希和三轮正在对峙中，在三轮面前真希表现出了无法用咒术师等级评判的压倒性的强大，让三轮无法掩饰自己的惊讶。与此同时，钉崎追逐着用扫帚在空中飞翔的西宫。将真依作为女性咒术师生存下去的的意义和辛苦一口气说了出来的西宫，却被钉崎反驳了回去。然后看不见身影在哪里的真依......

加茂遇见了伏黑惠，他的术式可以让他射出的箭无视物理规律，加茂前辈的术式名叫”赤血操术“，能够操纵自身血液和附着其血液的物体，但其实加茂还有术式叫做“十种影法术”，是禅院家代代相传的术式之一，以影子为媒介，召唤十种式神的术式，紧接着加茂开始近身攻击伏黑惠，血液操纵并不仅限于形状和运动轨迹，红血球等血液里的成分也能够自由操纵，在战斗中可以让自己拥有兴奋剂一般的超强体能。

突然闯入交流会，袭击众人的是特级咒灵·花御。与之对峙的伏黑、狗卷、加茂一边防御着攻击，一边朝着帐外奔跑。三人被追逼的时候，真希参战，与伏黑联手进攻。然而即便如此，在作为特级咒灵的花御压倒性的战斗力面前，众人仍处于窘境。

东堂还有虎杖还在和花御对战，东堂终于决定解禁自己的术式了，他告诉虎杖要绝对相信他，不要停下来。东堂发现，从地面生出来的“树根”，降低数量和射程的话强度和速度就会上升，“树鞠”攻击，一个鞠会伸出一至两根树枝攻击，攻击之后就会消失，他们还需要注意来自空中攻击的时间差，而诅咒种子正是伏黑中的那招，种子会戏曲咒力在体内生根发芽，东堂决定从根源处解决当下的局面，无论花御还有什么样的术式，只要通通不让它发动就好了。

五条以压倒性的实力击退了花御。濒死的花御与掠夺了特级咒物“两面宿傩之指”和“咒胎九相图1号～3号”的真人会合。脚踏实地在进行着于10月31日封印五条悟的准备。 另一方面，高专方面无法明确真人的目的。鉴于受灾情况，交流会也本应就此中止，但在五条的决定下靠棒球比赛分出胜负。 于是姐妹交流会的第2天开始了棒球比赛......

由于咒灵，3名男子在相似的情况下死亡。被害者们的共通点就是在同一所中学就读，虎杖、伏黑、钉崎被派遣去调查。 到了当地一看，发现那所中学是伏黑的母校。听说被害者们曾在当地的灵异地点“八十八桥”下一起倒下过。此外，伏黑的姐姐伏黑津美纪也被卷入了事件中......

虎杖、伏黑、钉崎与八十八桥的诅咒加上特级咒物“咒胎九相图”之一的血涂对峙了起来。在八十八桥诅咒的结界内突然钉崎被拉住手臂，消失在结界外。随后血涂往结界外跑了而虎杖也随之追了出去。剩下的伏黑很快就解决了八十八桥的诅咒——但此时眼前出现了冲击的景象。 另一方面，钉崎与另一位“咒胎九相图”之一的崩相对峙了起来。在那里血涂和追上来的虎杖也加入了战线......

虎杖和钉崎与“咒胎九相图”兄弟中的崩相和血涂针锋相对，但是因为浸入了崩相和血涂的血，钉崎体内开始腐蚀。即使被逼到绝境，钉崎还是亲自用钉子刺伤自己，发动“共鸣”。和崩相兄弟的忍耐比拼开始了。虎杖也不停地攻击着血涂...... 本次的任务是以“两面宿傩之指”为开端。到底虎杖、钉崎、伏黑能否平安返回高专呢?