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神曲乐士的塔塔拉‧佛隆和他的契约精灵-克缇卡儿蒂，一同来到了人类与精灵共居的大陆“波利佛尼卡”中的帝都美那朵。他们在街上遇见了一位忧愁的少女美崎，少女受到佛隆的鼓励后，决定潜入正要执行爆破拆除的旧房子里面，去寻找奶奶的遗物。在屋子因为爆破而倒塌的千钧一发之际，传来了一道乐音…
某天，拓植神曲乐士派遣事务所里来了一位名为玛乌拉的女性。她说最近常常觉得被精灵偷窥而感到相当困扰。蓝伯特前去勘查情况时，不小心让可能是犯人的精灵给逃跑了。后来，佛隆等人也加入了搜捕偷窥精灵的行列，没想到，却出现了意想不到的发展…
由于某所海运公司的公司继承权之争，拓植事务所的一行人来到了海水浴场。公司现任老板在过去因为遇到沉船事故，不小心将一只皮箱遗留在船长室忘了带出来，他表示率先寻回皮箱的人，便有资格继承公司。哥哥委托拓植事务所协助，另一边弟弟也雇用了神曲乐士。正当佛隆和克缇一起潜入海中执行任务时，却遭到神秘的神曲乐士突袭…
故事发生在三年前的托尔巴斯神曲学院，尤吉莉两姐妹前往梦想中的学府参观时，认识了学生时代的佛隆。後来因为重要的东西不小心遗失在学校里了，两姊妹便半夜返回学校寻找，正巧听见佛隆在唱歌，美妙的歌声深深感动了她们。可是在这同时，被囚禁在学院地窖深处的精灵，对歌声产生了剧烈的反应…
这次的客户是神曲乐士铃奈，她担心自己的契约精灵克琪诺似乎是变心了。相对於佛隆等乐士的谨慎回答，精灵们都直言“如果真的变心，那问题一定是出在铃奈身上”。这次由尤芬丽和她的契约精灵雅帝欧负责搜查，而出现在他们面前的人物竟然是是狄伦和梅尔里特！
小女孩艾莉儿想找回她走丢的爱猫，佛隆和克缇为了帮她而在大街小巷中到处跑。可是佛隆的状况似乎不太好，一回到事务所就病倒了。代替他寻猫的蓝伯特动作拖拖拉拉的，这种与佛隆迥异的作事风格，让艾莉儿紧张不已，逼得蓝伯特只好大展身手…
佛隆在学生时代的朋友雅姆那，在某一天的假日冲进了事务所。他正被两名陌生的黑衣人追杀，只好前来向佛隆求救。佛隆和克缇卡儿蒂对于走投无路的雅姆那伸出援手，帮助他逃亡。紧追不舍的黑衣人和他们在街上展开了飞车追逐…
贝尔莎妮朵和普利妮希卡一如往常精神饱满的来到了事务所，不过普莉妮似乎有点心神不宁的样子，原来她收到了学弟写的情书了。欢声沸腾的事务所中，克缇卡儿蒂的脸上却闪过一丝复杂的神情。在情书上写着见面地点中，真相即将大白了。
佛隆的神曲无法传达给克缇卡儿蒂。面对陷入低潮期的佛隆，克缇忍不住说了狠话。尤芬丽主动推荐给她一位名叫萨雷的老作曲家。克缇为了佛隆便前去向他邀曲，可是萨雷却不愿意动笔，他的理由是…
蓝伯特负责一起火场建筑拆迁的工程业务，却在途中遭到狄伦的契约精灵攻击而不幸受伤。一直以来，狄伦对梅尔里特蛮横又专制的态度令人不解，佛隆和克缇卡儿蒂针对这一切开始进行调查。原来蓝伯特遭受攻击的地点，埋藏了狄伦不为人知的过去。
佛隆和克缇卡儿蒂去造访知名天才工程师特拉多‧德鲁敏的研究所。他和精灵克莉丝塔的梦想是发明不需要神曲乐士、可以全自动演奏神曲的单人乐团。佛隆和克缇藉由这个计划，重新思考人类和精灵之间的问题，没想到这时竟然传出了意外…
伴着全自动的单人乐团“拟虹”，克莉丝塔不断的演唱着神曲，佛隆和克缇卡儿蒂再次对人类和精灵之间的羁绊-神曲的意义提出了疑问。而此时，对精灵抱有敌意的破坏计画也正在酝酿，这股暴戾之气即将狂卷而来…
