18岁的本须和秀树住在北海道的乡村，落榜的他来到东京进入补习班，为来年的入学考试做准备。在东京随处可见与真人没有多大差别的人形电脑，除了拥有作为数据接续端子的耳朵外。秀树渴望也有一个属于自己的电脑。一个偶然的机会，秀树在自己宿舍附近的垃圾堆里捡到一个非常可爱的少女外表电脑，她没有安装任何软件，所以什么也不懂。

第二日早上，秀树与邻居新保弘一起研究昨晚捡到的人形电脑。却把新保弘的便携式自制电脑丝茉茉损坏掉。无奈的秀树带着人形电脑来到新保弘推荐的国分寺稔家。国分寺稔推测人形电脑是传说中的Chobits，但他需要做一些研究以便进一步确定。在送秀树离开时，国分寺稔建议秀树千万不要爱上人形电脑。回到家的秀树因为人形电脑只会发出“叽”的叫声，于是就给她起名“叽”。

秀树的存款所剩无几，于是四处寻找工作。但是因为经济不景气，秀树没有找到工作。秀树垂头丧气的走在街上，被乐意之至居酒屋的裕美无意间用水弄湿衣服，在换穿居酒屋的工作服后，又被当做新进的职员分配任务。误打误撞，秀树因为勤劳认真被老板大村铁哉留下来成为居酒屋的服务员。于此同时，叽学会一些日常用语，但她喜欢指着所有东西叫“秀树”让秀树很头疼。

在秀树的教导下，叽学会很多日常用语。但是对叽来说，最重要的还是衣服。管理员日比谷千岁送来外套，仍然缺少内裤。秀树在女式内衣店外徘徊多时，却因为害羞不敢走进去，于是秀树回到家交待叽自己买衣服。新保弘把丝茉茉借给秀树，用作叽的导航仪，在丝茉茉的引导下，叽自己出门买内裤。经过一系列乌龙事件后，叽成功买回一条男士内裤。最终，还是秀树鼓起勇气为叽买回女式内裤。

后天有一场比较重要的考试，秀树向乐意之至居酒屋的老板请了一天假，打算在家好好复习。复习的过程中，秀树发现自己的英语字典遗忘在老家，于是带着叽去书店买字典。因为钱不够，秀树只为叽买了画册《没有人的小镇》。新保弘借给秀树字典，秀树便在新保弘的屋子里复习。等他回到自己的屋子时发现叽浑身发光浮在半空，却找不到原因。在叽的鼓励下，秀树坚持复习，最终顺利通过考试。

叽突然变的和之前不一样，反应变慢，原来是因为叽的电量减少。人形电脑平时在户外可以利用太阳能自我充电，而叽因为很少出门所以只能用充电器充电。秀树没钱交电费、电话费等，使得叽没法充电。于是秀树背着叽去乐意之至居酒屋，本打算走近路的秀树，因为道路维修反而绕了远路。关键时刻，管理员日比谷千岁出现，把秀树和叽带回公寓，并给叽充满电。

秀树一如既往的打工、上补习班，还有为缺钱发愁。叽为让秀树高兴，决定出门打工。秀树担心单纯的叽被骗，告诉叽只能做好的工作。牢记着秀树话的叽在街上寻找工作，因为对方的一句好的工作被骗到偷窥小屋。国分寺稔在网上发现叽在偷窥小屋，便用紧急邮件通知秀树。秀树在丝茉茉的指导下，终于找到偷窥小屋。秀树还是晚了一步，偷窥小屋的老板按下了叽的电脑开关。

秀树爬到7楼，叽已不在偷窥小屋，秀树又跑到街上继续寻找叽。此时的叽停在车站前的钟表上，周围的人形电脑突然间全部停机，国分寺稔制作的超级电脑柚姬也不例外。秀树追着在路灯上方跳跃的叽来到护城河边，在叽即将掉入河中时救下了叽。第二天，担心叽会再次出事的秀树，帮叽找了份工作—奇洛如蛋糕店五周年庆祝活动促销员。店长植田弘康在活动结束后继续雇佣叽，并告诉叽只能拥抱自己喜欢的人。

这一集通过新保弘与丝茉茉的对话，对前八集的剧情进行回顾。丝茉茉的内存不够，需要删除不用的软件释放多余的空间。新保弘让丝茉茉搜索的软件都与秀树、叽相关—庆祝秀树搬家用歌曲、内裤店路线图、偷窥小屋路线图、人形电脑充电方法。新保弘虽然抱怨秀树给自己增添很多麻烦，仍然没有让丝茉茉删除这些记录，而是答应丝茉茉买新的内存卡。

秀树告诉叽，叽打工得到的薪水不用交给他，留着买叽喜欢的东西。于是叽去书店给秀树买本泳装杂志，给自己买了《没有人的小镇续集》。国分寺稔给秀树一张照片，照片上的“叽”（实际上是其姐姐芙蕾雅）插满数据线，腿上还写着“hobits”。在于新保弘的交谈中，秀树得知要定期给人形电脑洗澡。秀树为了教会叽洗澡，用尽各种方法，仍然失败。最终，在管理员日比谷千岁的帮助下，叽学会洗澡。

秀树与裕美在公园划船时，碰到同样在划船的国分寺稔。国分寺稔有一个因病去世的姐姐，柚姬正是他按照替其姐姐的形象制造的。国分寺稔告诉秀树机器就是机器，无法代替真人，尽管他自己都很逃避面对这一事实。在家看画册的叽听到呼唤声，闭上眼的叽看到与自己一模一样的人形电脑，人形电脑告诉叽她就是叽，她会与叽一起寻找“只属于我的人”。

秀树和叽去国分寺稔家问关于网络的事情，被柚姬讲的关于城崎公寓104房间的鬼故事吓到。被秀树纠缠不止的新保弘，带着国分寺稔一行人查探缘由。原来，管理员日比谷千岁在搬进来时把公寓1楼的4间房子改成3间，缺少的是102，而不断闪现的光是日比谷千岁想要更换灯泡时造成的。秀树终于放心，却无人发现叽却在公寓里多次听到呼唤声。

居酒屋店长大村铁哉村借给秀树一套DVD播放机，秀树去买DVD的时候碰到前来购买游戏的国分寺稔，国分寺稔送给秀树一套游戏。等大家进入游戏后，却发现叽不在。第二天晚上，叽一次没有出现。为寻找叽，秀树等人遭遇大魔王，在大家即将失败的时候，叽突然出现打败大魔王。叽却没有任何游戏记忆，国分寺稔推测叽无法进入游戏是因为她有超越一般电脑的性能。

夏天即将到来，新保弘邀请大家去海边玩。因为国分寺稔在海边有别墅，大家可以免费住宿，因此秀树和叽也加入到海边游中。因为秀树不会游泳，大家乘坐国分寺稔的私人游艇近距离观看海豚。秀树看到海豚跃出海面非常高兴，于是叽跳入海中想要让他更高兴。秀树也跳入海中去救叽，却反被叽救了。最后大家安全无事的回到国分寺稔的别墅。

梅雨季节过去，夏天终于到来，炎热的天气让所有人都躲在有空调的地方。这是秀树在东京度过的第一个夏天，对他来说，天气尤其闷热。秀树正在给叽解释什么是夏天，补习学校的老师清水多香子突然敲响房门。清水多香子在秀树这里借住一晚，新保弘听说这件事后反应激烈。晚上，打完工的秀树在回公寓的路上，看到新保弘与清水多香子在路灯下拥吻。

第二天，把丝茉茉留给秀树照顾的新保弘没去上学，清水多香子也未出现在补习学校。通过新保弘打来的电话，秀树得知两人已私奔。清水多香子的丈夫因为一直沉迷于人型电脑，经常冷落她。新保弘不忍心让清水多香子感到孤单，于是故作勇气追求她。两人本打算好好谈谈，清水多香子因为害怕所以去秀树那里借住，却因为秀树的一番话心里有所松动，最终与新保弘私奔。

秀树上一次的考试很不理想，所有成绩都是E。在清水多香子老师的建一下，秀树向居酒屋请一个星期的假，准备好好复习参加接下来的全国模拟考。不幸的是秀树弄丢了刚发的工资，于是只能忍饥挨饿的进行复习。叽想让秀树恢复精神，在管理员日比谷千岁的帮助下，叽成功的做出咖喱饭，笑容再一次回到深受感动的秀树脸上。

这一集通过国分寺稔与柚姬的对话，对前十七集的剧情进行回顾。国分寺稔对叽的研究进入瓶颈期，除了上次在网上找到的照片，查不到其他信息，对照片的分析也一无所获。国分寺稔采取柚姬的建议，回顾叽的成长过程，想发现一些有用的线索。线索终归太少，不足以做研究，但是国分寺稔却在慢慢的解开姐姐去世带给自己的心结。

一大早，秀树和叽被丝茉茉吵醒，发现日比谷千岁正在晒被子，于是三人也加入到大扫除中。秀树无意发中现楼上有间布满数据线的屋子，丝茉茉碰到数据线没了反应。在日比谷千岁的帮助下，丝茉茉恢复正常。原来日比谷千岁以前从事过电脑相关行业，在从事同样工作的丈夫去世后搬到公寓里生活。听从日比谷千岁的建议，秀树正在给丝茉茉设置密码，屋外却有两个陌生人在寻找叽。

人与人形电脑是什么样的关系，这个问题让秀树很困扰。一路烦恼的秀树回到公寓发现叽不在，恰逢奇洛如蛋糕店的店长打来电话，询问叽为什么没有上班。意识到叽遭遇不测的秀树四处寻找无果，只能向国分寺稔求助。此时的叽正在小岛良由起的房间里，因为对chobits感兴趣，小岛良由起就将在书店前的叽绑架。日比谷千岁全都知道这些，却因为与丈夫的预定只能在一旁看着一切发生。

秀树与国分寺稔见面后分析得出，叽是被对Chobits感兴趣的人带走。担心叽的秀树不等国分寺稔说完，再一次跑到街上寻找叽，碰到前来帮忙的蛋糕店店长植田弘康。植田弘康曾和自己的电脑结婚，在一次车祸中为救植田弘康，他的电脑受到严重的损害无法复原。植田弘康的故事给秀树很大的鼓舞。在家分析资料的国分寺稔再一次收到关于叽的信息。

国分寺稔收到的是一张地图，经过柚姬的对比分析，最终确定“蜻蜓”小岛良由起的住所。小岛良由起正在用20台电脑分析叽，却激活了叽的防御体系，被叽用数据线绑起来，所有的电脑再一次当机。等秀树与新保弘赶到小岛良由起的家时，叽全身发光，之后便失去意识。而日比谷千岁在公寓里继续画《没有人的小镇》，神秘人之一则对着电脑中的地图深思。

网络传言，人形电脑由一个神秘组织开发，因为组织者与研发者之间的矛盾，研发者私自开发Chobits系列，日比谷千岁是核心研发人员之一。柚姬想要替国分寺稔分担破解工作，因此一个人强行侵入组织网络中下载文件。由于对方的拦截，柚姬失去关于国分寺稔姐姐的资料，国分寺稔拒绝再次输入这些信息，因为他终于明白“没有人可以代替姐姐，同时也没有人可以代替柚姬”。

裕美曾在植田弘康的蛋糕店里打工，两人渐渐互生爱意。自卑的裕美怕植田弘康因为自己不像电脑那样全能而不再爱自己，于是率先提出分手。但是裕美仍然会去蛋糕店外偷看植田弘康，在看到叽穿着植田弘康为她制作的制服时，裕美哭着离开。听到叽说裕美经常来偷看的事，植田弘康终于鼓足勇气，来到裕美面前。听完植田弘康的话，裕美终于解开心结。

日比谷千岁与丈夫都是研究所的人员，日比谷千岁不能生育，她的丈夫制作Chobits系列—芙蕾雅和爱尔塔作为两人的孩子。芙蕾雅因为爱上日比谷千岁的丈夫强行删除自己的记忆，日比谷千岁则初始化爱尔塔，把她丢在垃圾场以便让秀树捡到。秀树边走边思考自己对叽是什么样的感情，回到房间时被叽问到“秀树是不是只属于叽的人”。

听到秀树说“我喜欢叽”，叽立刻启动既定程序，神秘二人组突然出现进行阻拦。叽在马上成功时放弃了，因为“电脑代替不了人”，并把体内的芙蕾雅变出来。日比谷小姐报出密码“CHOBITS”，删除她们的所有资料。面对秀树心痛的表白，电脑留下眼泪，叽重新出现，执行完程序。一切回到正轨，但是有些东西已经改变，并在悄悄的发挥作用。

这一集通过日比谷千岁和小岛良由起的电脑琴子的对话，对第十九集到第二十六集的剧情进行回顾。今天是秀树领取录取通知的日子，秀树和叽去拿通知，而日比谷千岁则在家打扫屋子，准备一顿丰盛的午餐招待将要到来的客人。新保弘要和清水多香子结婚，因此找了份工作，尽管有好几个大学发来录取通知书。所有人的生活都在想着美好前进。