许久以前，世上曾发生一场战争。破坏神驱使黑暗包围了世界，企图将所有的文明毁灭，不过人类世界在人称“七骑士”的英雄们努力之下得以续存。随着时光流转，崇尚破坏神的教团“弗西斯”企图再次完成过去破坏神未竟的“救赎”，释放“破坏”的怪物四处肆虐，凡过之境无不遍地。能借用古代英雄力量来战斗的“七骑士”之一的少女法里亚为了对抗“费希斯”，来到惨遭魔兽袭击、被烧毁的村落，并在这里遇见名为尼莫的少年。尼莫在危机中觉醒，得到一股强大得连法里亚也不禁讶异的力量。

“格兰希学院”，人称＂伟大种子＂的这所学院，正是负责培育少年少女们，使英雄寄宿其身来战斗、对抗破坏军的摇篮。在七骑士成员的法里亚的引导下，尼莫来到格兰希学院，遇见憎恨“弗西斯”的少年剑士乔・鹤木。乔相当反弹法里亚安排加入尼莫七骑士的决定。在遇见个性十足的七骑士众人后，尼莫自身也开始产生了变化。但黑暗却已悄悄地对和平的校园生活伸出了魔掌。

自然之理的攻势越发激烈，尼莫也在仍不知寄宿自己身体里的力量的真实身份下，一同前往严峻的战场。前线奋力战斗的人群中，有着肩挑着小小王国命运的王子吉尔丹的身影。看见尼莫展现的惊人力量，让吉尔丹涌起了自己或许会失去立足之地的不安，并且被焦躁给吞噬。吞噬少年们的黑暗究竟会何去何从。

尼莫终于渐渐被认同为“七骑士”的一员。然而拯救吉尔丹却也让他付出极大的代价，耗尽魔力不支倒地。法里亚因而片刻不离地照顾他。吉尔丹为何会被拖进破坏之力引发“侵占”？尼莫到底是什么人？“七骑士”成员们在度过和平的片刻时亦各自怀着疑惑。另一方面，法里亚偷偷饲养的猫咪逃出了居室，尼莫和法里亚为了不让其他人发现，只好努力追捕猫咪。

尼莫至今仍完全不了解寄宿在自己身上、从未说出自身名谓的这个英雄，究竟隐藏着什么样的真相。有天，学院中发生了风纪委员接二连三遭受吸血鬼攻击的事件。尼莫虽然主动表明想要帮助怒火中烧的雪莉，但雪莉并不领情，仍只想靠一己之力解决事件。然而引发事件的吸血鬼早已盯上了雪莉。

加雷斯抽丝剥茧地解析至今的事件，想仅靠一己之力找出事件背后蠢蠢欲动的阴谋。而图书委员的克蕾儿虽然一心想帮上他的忙，加雷斯却不怎么领情。另一方面，格兰希学院即将迎来学院祭，到处都充满着活动前的喧闹。“七骑士”一行人不亦乐乎地聊着恋爱的话题，众人最在意的就是学院季尾声时举办的双人舞，大家对彼此会找谁当舞伴都很感兴趣，尼莫当然也不例外。当雪莉指名要尼莫当她的舞伴时，让讨论变得更加热烈。

克蕾儿因“旧图书馆”的诅咒而丧命。但与自然之理的战争迫在眉睫，众人无法仅为缅怀一条生命而放慢角度。理事会命令学生会出击前往“布尔戈火山”阻止自然之理即将引发的大规模魔术灾害。只能听从大人们的命令率领学生们赶赴战场，令法里亚感到相当苦恼。有三个战士在自然之理的基地迎击法里亚等人，但他们竟也与格兰希学院的学生一样，是能够与英雄签约使用英雄之力的“继承者”。

被破坏之力侵蚀而失去理智的格兰希战士们。阿米斯.杰罗曼为达成破坏物质世界秩序的野心四处破坏银沙漏，此时此刻，他的企图看似就要达成了。然而包含尼莫在内的“七骑士”以通力合作对抗无法真正使用英雄之力、也不懂得如何合作的“人造继承者”芮达、卢克斯和卡斯特尔三人。

“七骑士”迎来与阿米斯.杰罗曼的最终决战。面对像英雄借力战斗的少年少女，杰罗曼发出豪语声称自己才是这个时代的英雄，并展现他压倒性的实力。芮达发现自己只不过是弃子，愤而向亚依林借力挑战杰罗曼。另一方面，加雷斯从索菲蒂亚口中得知＜旧图书馆＞的秘密，一步步逼近克蕾儿死亡的真相。

尼莫由于身为能使用“旧图书馆诅咒”之力的“破坏之子”而遭到众人囚禁。法里亚等人虽因此倍感动摇，却无法撼动加雷斯找到的不争事实。尼莫开口诉说自己为了活下来，在吉尼尔斯的引导下逃出“自然之理”的掌控，装成人类的样子摆出笑脸只为求生存的过去。法里亚与尤诺米亚交谈，试图找出“旧图书馆诅咒”的真相，而在旧图书馆中找到“时之书”，为了寻求被掩埋的过去，决定前往与尼莫相遇的地点“乌里村”。

在法里亚和芮达的帮助下，尼莫逃出格兰希学院，重新体认自己到底该做什么、追求什么。他找到的答案是要保护自己珍惜的事物。身体已遭“旧图书馆的诅咒”侵蚀的法里亚发誓赌上自己的生命与尼莫并肩作战。另一方面，格兰希学院因诅咒的力量解放即将殃及全世界，尼莫等人为了阻止灾厄，乘着飞艇再度回到学院，这时，阻挡眼前的，竟是他们最为珍惜的朋友们。

索菲蒂亚终於表现出她的疯野心，她口中的救其赎实是赐予所有生命平等的死亡。她作为破坏神降世的化身发动了攻势，使格兰希学院陷入了火海。为了了黑色助意图阻止索菲蒂亚的尼莫和法里亚，七骑士们一个凭著自己的决心挺身对抗，一同面对最后的大战。一切都是为达五色的事，为了实现在自己的心愿。