海边的小城市·楢崎町。这里有着“不会消失的彩虹”和“Gift”两个不可思议的现象。生活在这个城市的居民可以使用Gift这种不可思议的力量。拥有使赠送方和接受方的协议诞生奇迹那样一生一次的魔法。天海春彦就是在那样的奇迹中接受并温暖的守护着Gift。春彦在这个成为了志摩野学园二年级学生的春天，与他新的相遇与再会。

新学期开始了，春彦他们卷进了由Gift所引发的骚动。总算回到了家，家门前伫立着义妹深峰莉子。莉子是现在已故的春彦母亲的远亲，曾经被春彦的父亲·天海壮一收养着一起生活。但是因为某些情况，莉子和春彦他们分开了。时隔数年和莉子久违再会的喜悦，还有雾乃和春彦与年幼的时候一样也有点不同。三人一起度过的日子开始了。但是仰望没有消失的彩虹的莉子，为什么会浮现出有点忧伤的表情……。

莉子被编入志摩野学园春彦的班级。班上男子嫉妒春彦这对没有血缘关系的兄妹！？另一方面，莉子和雾乃的好友藤宫千纱、一心一意剑道的外薗纶花、藤宫家的女仆的神代缘她们认识，早就适应了学园。有一天，莉子在购物中的照片，突然被杂志凹版相片装饰起来。一时间求爱的男子激增，使莉子非常困惑。春彦虽然担心她的情况，但是却无法掩饰焦虑的心情……。

Gift创造的酷暑，楢崎町即将迎来短暂的夏天。立刻春彦的死党江户真纪，召集朋友策划了全体成员参加的海水浴。沙滩上雾乃和千纱、纶花、还有缘她们也在。这是真纪的苦心，一个让春彦和莉子和好的机会。和莉子的感情相反，无法顺利的把心情传达给春彦。两人的距离到目前为止没有接近。焦急的真纪使用最后的手段召开试胆大会。然而受到意想不到的人的帮助，仅仅试胆大会上发生惊天动地的事件！？

努力练习剑术的纶花，一个人倾注热情的少女。她的名字叫里绪奈美。和春彦他们一样是志摩野学园二年级学生，很热心应援纶花的支持者（跟踪狂？）。不选TPO接近奈美的做法，就连纶花也有些招架不住。纶花为了让奈美自重，决定让春彦扮演恋人的样子。这是为了让勇往直前的奈美放弃，没有别的选择。“我，想要和纶花在一起！”如此呼喊奈美的想法，导致Gift失控……！

在楢崎町Gift产生的奇迹是日常生活中的一部分。现在这个小镇上，从今年春天开始发生了另一个不可思议的话题“伪Gift”。乘着小扫帚的魔女，会用伪Gift的魔法帮忙人们实现愿望。雾乃悲哀地凝视着春彦与莉子和好的样子，她对春彦不能和以前那样相处而烦恼着。在这样情况下的雾乃面前，魔女携带着伪Gift出现了。“想回去，回到那个时候……”面对雾乃的呼声，使得假Gift发出了光芒。那个魔法对春彦生活带来的变化是？

雾乃与魔女相遇的第二天，感觉到了自己身体变化的春彦。与莉子在一起的每件事，都和除照片以外其他什么都不知道的已故母亲・晴重叠起来。春彦从雾乃那里知晓是假Gift的原因。“想和春彦好好相处”――受到雾乃含糊其词愿望的影响，魔法过度反应的结果。为了解开假Gift的效果，春彦寻找魔女。在心中春彦在继续问自己，对莉子的心情是真的吗？是她跟母亲的模样重叠、还是……。

重要的不是拘泥于过去的回忆，和莉子守护着接下来度过的时间——通过伪Gift这件事，春彦对莉子产生新的思念。在那样的情况下雾乃坚持自己的心意没有虚伪地向春彦告白。修学旅行的前一天。雾乃将决意倾注了瞳孔，叫住了春彦和莉子。春彦他们前往的旅游圣地有一座能成就恋爱地有名的寺庙。“想要那里的护身符，从春彦那里给我的……”雾乃在那样告诉的面前，春彦选择的答案是？

在修学旅行的时候，春彦和莉子互相确认了彼此的心情。春彦选择了莉子作为最重要的对象。因此成就恋爱的护身符无法带送给雾乃。因为那是春彦的回答，所以雾乃试图祝福两人。但是要使悲伤的心情舒畅需要一定的时间。直到有一天，雾乃从春彦的话里知晓了不会消失的彩虹是莉子赠送的。雾乃、莉子和春彦，到现在为止一直连接着三个人信赖的心擦肩而过。羁绊中断，只有悲伤持续扩大下去——。

Gift产生的奇迹等于魔法般的力量，也有以此为契机相结合的恋爱。正因为如此绝对不能送喜欢的人——。雾乃和莉子在年幼的时候形成这样的约定。选择了莉子，和莉子送出的Gift彩虹没有关系，如此说着的春彦，如今的雾乃已听不到。然后，莉子为违反了约定的事想向雾乃道歉，终于雾乃为了确认莉子的诚意，亮出残酷的选择。“回忆还给我”雾乃向莉子展开了双手，下定决心的莉子伸出双手与雾乃重合。

莉子，到现在为止和春彦度过的每天的回忆都失去了。那个记忆，春彦的回忆，继承的是雾乃。自然的结果袖长，绝对不可能发生的奇迹。那是，雾乃和莉子之间的“正确的”Gift被交换的证明。至今为止春彦确信Gift奇迹的力量，是让使用的人幸福。但是现在，两个人所期望的是“幸福”吗？为了取回莉子的记忆和笑容，然后为了拯救雾乃的心，Gift在这个城市存在的理由，春彦挑战Gift的谜。

在楢崎町被称为Gift不可思议的现象。到底是什么时候诞生的，又是为什么而存在的呢？追逐着这个谜题的春彦，终于“Gift诞生日”的秘密被知晓。Gift，是这个城市居住者能使用的一生一次的奇迹。作为心爱的人唯一的礼物，任何愿望都会实现的魔法一样的力量。这是人与人的心的纽带而产生的希望。重要的人的笑脸，恢复再一次中断了羁绊，春彦坚定的决心，然后――。