以广大的世界及高度的自由度著称的DMMO-RPG“YGGDRASIL”。曾经红极一时的这款游戏后来也逐渐变得低迷，终于决定停服。在最后一天，公会“安兹·乌尔·恭”的会长·飞鼠，在根据地纳萨立克的地下大坟墓等待着同伴的来访。但，多数的公会成员已经引退，久违地登录进来的同伴也很快就回去了。飞鼠独自一人迎来最后的时刻，然而……。

突然间无法从“YGGDRASIL”登出，NPC们开始如同人类一般行动。飞鼠在陷入混乱的同时，对于NPC被设定的绝对忠诚可能会产生变化而感到担忧。但，以立于纳萨立克全部NPC顶点的守护者总管雅儿贝德为首，各阶层的守护者都展示出对主人真心的忠诚。为了不背叛雅儿贝德等人的期待，飞鼠表现出完美支配者的姿态。

在确认魔法道具“远端透视镜”的使用方法时，飞鼠发现了人类居住的村子。这个小村子遭到疑似骑士团的战士袭击，连女人和小孩都被毫不留情地杀害。似乎是由于不死化的缘故，即使看到这样悲惨的光景，飞鼠仍然保持平静。他最初想要放弃这个村子，但之后改变了主意，想要试一试自己的力量。飞鼠向着村子转移，并与袭击村子的骑士们对峙。他利用强力的魔法试图推测敌人的力量，但……。

袭击了里·耶斯提杰王国边境上卡恩村的，是装扮成他国骑士的斯连教国特殊部队“阳光圣典”。他们真正的目的是将王国最强的著名战士长葛杰夫抹杀。葛杰夫虽然察觉到了这点，但他为了拯救村子而选择了与阳光圣典战斗的道路。但拥有魔法吟唱者的敌人有着压倒性的强大，葛杰夫的部下接连倒地。葛杰夫也凭着自己的武技奋战，但他在多处负伤之下，终于用尽了力量。

卡恩村事件后，安兹将战斗女仆（昴宿星团）娜贝拉尔收为仆从，来到了里·耶斯提杰王国的城塞都市“耶·兰提尔”。两人以飞飞和娜贝的名字加入了冒险者组合，为了获得情报和金钱而提升自己的名声。但，对于最低等级“铜”的冒险者来说，仅能得到最为简单的工作。此时，飞飞等人从“银”的冒险者队伍“漆黑之剑”那里受到了一同工作的邀请。

被恩弗雷亚委托护卫的飞飞，与“漆黑之剑”一同，一边狩猎怪物一边前往卡恩村。“漆黑之剑”的成员们展示出漂亮的合作，但他们却为轻松挥舞两把大剑砍倒怪物的飞飞的力量感到胆寒。“漆黑之间”众人感慨于这种连被称为活着的传说的“精钢级”都能匹敌的强大，怀着尊敬与好意与飞飞接触，但……。

在距离卡恩村不远之处，恩弗雷亚注意到了村子的变化。周围被严密的栅栏围起来的村子十分可疑。之后，武装的哥布林突然出现，一行人遭到包围。在紧迫的空气当中，恩弗雷亚喜欢的少女·安莉从村子中跑出来。从安莉那里听闻卡恩村遭到袭击的详情后，恩弗雷亚察觉到拯救了村子的安兹·乌尔·恭的真实身份就是飞飞……。

漆黑之剑的冒险者护送恩弗雷亚回家时被蹲守的克莱门汀与死灵法师蹲守致使全军覆没。死灵法师通过控制恩弗雷亚使用智者头冠发动第七阶魔法[死灵军团]，兰提尔镇陷入了绝境危机。虽非飞飞本意，但飞飞打算利用本次事件进一步提升自己声望，同时以就回恩弗雷亚为条件要挟莉琪献出全部为其服务……

在墓地，飞飞和娜贝拉尔分别迎击克莱门汀与死灵法师。死灵法师利用亡者宝珠的力量召唤了具有免疫6阶以下魔法特性的古龙进行攻击，碍于身份限制，娜贝拉尔一度处于下风。另一方面，飞飞通过测试克莱门汀的实力学到新的战斗知识。娱乐够后，飞飞下令解除娜贝拉尔的限制……

另一方面，夏提雅和赛巴斯根据飞飞的安排分别寻找具有强大战斗力的人及收集王都情报。夏提雅通过预设的陷阱获知了武技使用者布莱恩的据点并轻松攻破，但在追击漏网的逃兵时意外遭遇斯连教国精英部队的攻击。由于大意，夏提雅虽击退了敌人却陷入了不明状态，并被纳萨力克判定为反叛者……

飞飞前往夏提雅所在之处，打算通过超超级道具流星之戒的超位魔法[许愿]的效果消除夏提雅的负面状态，但最终以失败而告终，飞飞猛然醒悟原来是世界级道具在作祟。不得已之下，飞飞前往宝库领取世界级道具，准备与夏提雅决一死战……

不带军队和护卫，艾因斯一个人与夏尔蒂亚对峙。尤格拉希尔存在着复活的魔法。但是这个世界能不能使用，还没有确认。在如字面那样拼上性命的战斗前，爱因斯仔细的准备着。与此同时，在纳萨利克，德米尔戈斯暴露了愤怒。不能失去应该发誓忠诚的最后主人，带领部下到爱因斯的原来……

被夏尔提亚强迫苦战中，艾因斯发动了即死系魔法，由于被编入了的技能的效果，打算毁灭对即死效果具有完全耐性的夏尔提亚及其家人。但是，重要的夏尔提亚使用所持有的苏生道具，打消魔法的效果。对使用完MP和技能的两者被留下了的，对夏露蒂亚来说压倒性地有利的接近战。对确信胜利的夏尔蒂亚，艾因斯说出了全部。