曾被称为天才小提琴少女的小日向奏，某天在演奏会上收到一封没有署名的信。就在同一时刻，离开家乡到横滨星奏学院就读的青梅竹马如月律，邀请奏去观赏他的演奏会。奏和律的弟弟响也一起前往横滨。见到久违的律，奏感觉他变得和以前有些不同。在演奏会结束后，主办单位正式对外宣布即将举办全国学生音乐大赛的消息，让整个会场顿时热闹不已。然而律却对奏和响也说”到我的身边来吧”……。

转学到星奏学院，成为管弦部所属成员的奏和响也。对于管弦部部长律宣布他们被选为全国学生音乐大赛的成员时，奏和响也感到相当惊讶。而且此事还引起其他部员的不满，尤其是才一年级就被选为为大提琴手的水嶋悠人，更是无法接受自己必须和实力不明的两人组成合奏团，为此律决定举办选拔试验。措手不及的事情接连发生，就在奏为混乱的情况烦恼不已时，眼前出现了一个打算把大提琴丢掉的未知少年……。

悠人的儿时同伴七海宗介决心努力重回室内学部，陪着宗介造访天音学园的奏等人，遇见了室内乐部部长冥加玲士。冥加似乎认识奏，但奏却对他毫无印象也对冥加的反应感到不知所措。之后，神秘的天音学园的钢琴名手天宫静向奏说出“我想和你谈场恋爱”的告白，并且和奏约会漫步横滨。

全国学生音乐大赛举办的日子即将到来。仙台至诚馆高校吹奏乐部的学生来到了奏等人的菩提树宿舍。奏认识了长相凶恶的火积，活泼开朗的水嶋以及带领他们的部长八木泽。就在星奏学院的成员加紧为音乐大赛做准备的同时，遇见了来到横滨的神南高校管弦乐部的部长东金，以及副部长土歧。东金在听过奏的演奏之後却对奏说“你的演奏平凡乏味”……

全国音乐大赛终于展开。没想到第三场演奏的对战对手竟然是至诚馆高校。被选为第二小提琴手的奏，对于必须与在菩提树宿舍一同渡过快乐时光的至诚馆高校成员对战感到相当苦恼。另一方面，至诚馆高校则是在做好赌上一切的觉悟後登上音乐大赛的舞台。在这场绝不能输的战斗中，至诚馆高校成员全心投入的演奏响彻整个会场。

受到至诚馆高校浑身解数的演奏所慑服的奏，带著不安的心情踏上了第三场演奏的舞台。想到自己的胜利将促使至诚馆高校吹奏乐部走上废部之路，奏不禁感到迷惘，连带影响了自己的演奏。陷入危机的星奏学院合奏乐团，律以壮士断腕的决心，用自己的音乐引导夥伴们往高处翱翔。然而律其实有事情瞒着奏和响也他们……。

在律的演奏的带领之下，星奏学院终于在第三场演奏会获得胜利。然而因为律过度使用手腕，导致他无法再继续参加音乐大赛。在这种情况下，律指定响也成为准决赛时的第一小提琴手。陷入不安的响也，情绪激动的跑出菩提树宿舍。另一方面，奏也在不安的情绪中，认真思考东金对她说过的“魅力”的意义。

奏和响也克服了不安情绪，为准决赛而努力练习。在律严厉的指导之下，四个人齐心向准决赛迈进。另一方面，神南高校因过去某场音乐大赛所发生的事情，为夺下此次对决的胜利，站上舞台的成员们无不全力以赴。以拥有广大人气自豪的神南高校管弦乐部部长东金为首，神南展现的华丽表演，让会场热气沸腾。接着上场应战的星奏学院则是必须面临一场绝不能输的战争。

在准决赛中星奏学院击败神南高校获得胜利。另一场准决赛，则因为冥加的过往使得战况往意料之外的方向发展。与天音学园对战的九州名校圣赛西尔女学院的圆城寺冴香，因为弟弟在和冥加对决后再也无法演奏小提琴，冴香为了复仇，抱着同归于尽的心态选择乐曲。准决赛结束后，天宫为了弥补自己音乐上的不足，再次对奏提出约会邀请。

星奏学院将在决赛舞台和天音学园一决高下。律指名奏为决赛时的第一小提琴手。第一次被委任第一小提琴的奏，对自己的能力不足感到苦恼。就在此时，天音学园的理事长亚力克士开始出现不明的举动。看见亚力克士来找奏的仁亚突然大发雷霆。神南高校的东金和土岐住进菩提树宿舍，并且带烦恼中的奏去看萤火虫。

音乐大赛终于进入决赛。以第一小提琴手的身份，终于掌握到属於自己的音乐的奏，发生了意想不到的意外。同时对于冥加为何对自己如此执着的事情，奏的脑海里开始浮现出模糊的记忆。七年前的奏以及冥加一起经历的过去，改变了奏和冥加的命运。现在,两个人为了对过往的事情做个了断，发誓将在决赛的舞台上展现出最棒的演奏。

奏和冥加平安抵达音乐赛会场。决赛正式展开。天宫和七海演奏出与以往不同的音乐。而冥加更是把他七年来的爱恨情仇全都灌注在演奏中，让整个会场被黑暗包覆，观众也被吞没在黑暗之中。另一方面对手星奏学院，则是为了律梦寐以求的全国优胜，团结一致登上决赛舞台。奏的音乐即将回复它本来光辉的面貌。