敢死队“罡甲”为了寻找黄金乡而踏上旅途。他们靠着队员之一的布耶可所持有的“星之罗盘”持续航行在未开发的海域。某天，暴风雨袭击罡甲队的船团，其他船只接连被巨浪吞噬，而布耶可在这时注意到罗盘屹立不摇地指向某个地方。就在她随即告知队长瓦兹强时，一座小岛出现在风暴的另一端。罡甲队历尽千辛万苦终于抵达了那座岛，而在那里他们发现了一个深不见底的巨型大洞。

结束了与波多尔多之间的壮烈战斗后，莉可、雷格及娜娜奇在这趟有去无回的“绝界行”的最后终于抵达了深界六层。莉可兴致盎然地观察着从未见过的建筑物和生物，并再次写信送出电报船要给孤儿院的同伴们，然而电报船却在她面前被巨大的原生生物给拦截了。同一时间，某个可疑的影子悄悄向继续探窟的莉可等人身后靠近。

在寻找被人抢走的普鲁修卡（白笛）时，莉可、雷格及娜娜奇来到了一座不可思议的村子，那里是拥有智能的“惨剧终末”们居住生活的地方。村子一位名叫玛其卡恰的居民向纳闷不已的三人搭话，说要带他们看看村子。他们一边保持警戒，一边跟在似乎知道白笛所在处的玛其卡恰身后。一行人来到村里的工房，看到一个惨剧终末正在将白笛刨削加工。雷格连忙想上前阻止，但莉可却感觉普鲁修卡对此并不反感。

雷格的面前出现了被称为惨剧终末公主的法普妲以及神秘人偶卡布伦。虽然法普妲似乎认识雷格，但雷格因为记忆模糊的关系无法清楚回想起来。另一方面，娜娜奇在村里的市场寻找水和水果要给吃坏肚子的莉可。玛其卡恰告诉他在村里必须使用“价值”来交易，而在思考对自己来说的“价值”是什么的时候，他想起了“米蒂”。

玛其卡恰告诉娜娜奇：“米蒂是三贤的贝拉芙在使用的。”而当他来到贝拉芙的住处时，竟看到本来应该早已告别的米蒂出现在那里。对于方寸大乱的奈奈祈，贝拉芙询问道：“你是为了什么而来？”另一方面，和法普妲分别后的雷格打算回去村子，但却迷了路。就在他被龙娑彩纠缠不休地攻击时，卡布伦出手救了他。

莉可试图挽回以自己为“价值”并将自己卖掉的奈奈祈，贝拉芙要求她要付出“双眼、双脚或一半的内脏”作为相对的代价。尽管烦恼不已，莉可还是做好了决定，但玛其卡恰却抢在前一刻说“不管被拿走什么都会完蛋”并阻止了她。而娜娜奇更是不愿意离开米蒂，还要莉可别管他，因此玛其卡恰便强行带离莉可。就在这时，原生生物大云霞突然闯进来袭击村子。

坦承自己是敢死队“罡甲”的幸存者的布耶可，向莉可等人说起了“惨剧终末村”不祥的成立经过。过去，罡甲队在瓦兹强的率领下来到了“不归之都”。发现黄金乡的喜悦只让他们开心半晌，很快地，他们就注意到升降所造成的异形诅咒让他们再也无法回到地面上。尽管队员们打定主意要作为黄金乡的第一批居民在此生活，但他们却在确保粮食和水源方面碰上了困难。

罡甲队的队员接连因为“拟态水”的侵蚀而倒下，最后连布耶可也发病了。不过在吃下瓦兹强给的“香气扑鼻的东西”之后，布耶可就恢复了健康。同样地，贝拉芙也康复了，但他却对于吃了那个“香气扑鼻的东西”而深感后悔，甚至因此精神失常。瓦兹强气定神闲地把犹疑不安的布耶可带到咿噜缪咿的身边，而布耶可在那里看到的竟是……

为了从贝拉芙手中夺回娜娜奇，雷格向法普妲表示想要她一部分的身体。法普妲以履行“某个约定”为条件，毫不犹豫地扯下自己的一部分交给雷格。尽管身为“不灭”的法普妲神色自若，对于雷格的担心不以为意，但血的气味却让野兽丧失了理智。雷格赶紧将法普妲身体的一部分带回“惨剧终末村”，但对于是否该履行和法普妲的约定，他却始终得不出结论。

由于雷格的火葬炮而得以闯入“惨剧终末村”的法普妲誓言要对所有村民复仇。在村子遭到破坏的同时，陷入沉睡的娜娜奇醒了过来。贝拉芙将自己的价值和记忆托付给娜娜奇并放他自由，但他告诉娜娜奇，一旦越过边界线米蒂就会消失。娜娜奇面临抉择，必须决定是该再次和米蒂道别，前往莉可和雷格身边，还是该留下来和米蒂永远在一起。

尽管雷格脑中浮现了法普妲的笑容及哭泣的脸庞等等零碎的记忆，他却依然无法清楚回想起过去的事情。阻止不了法普妲失控的他，在遭到攻击后就这样失去了意识。结束了与雷格之间的搏斗，法普妲进一步将愤怒的矛头指向莉可，对她展开了攻击，然而卡布伦却挺身出面制止她的行动。震惊的法普妲不减怒气，试图再次出手攻击莉可，这时娜娜奇出现了。

莉可、雷格及娜娜奇与玛其卡恰等人一起在逐渐崩塌瓦解的“惨剧终末村”中逃难，并与倒卧在地、动弹不得的瓦兹强两相对峙。瓦兹强问莉可是否庆幸自己来到此地，并说起了自己想达成的目的究竟为何。另一方面，体会到新的记忆与价值的法普妲为了达成自己的使命，再次与袭击村子的原生生物交战。