新宿区内发生了恶性连环犯罪事件——通称【X-Day事件】，身为警察的主人公就在这片危险的街道工作。她为了新宿区的安全日夜奔走，却在某个晚上被不明人物袭击，一个内♯♯药的项圈戴在了她的脖子上。之后，几个身份不明的男性出现在了不知所措的主人公面前。主人公得知，曾在警察组织中任职的他们，如今正在独自追查恶性犯罪事件。为了摘下让自己徘徊在生死边缘的项圈，为了解放被囚禁在恶意中的新宿，主人公开始参与他们的搜查——究竟是谁掌握着她的生死？新宿区又是否会迎来重生之日……